209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3105 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  100 
 
 
333 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  63.94 
 
 
340 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  65.15 
 
 
340 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  60.42 
 
 
344 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  59.94 
 
 
383 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  60.62 
 
 
344 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  59.64 
 
 
344 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  48.34 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  32.03 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  38.24 
 
 
355 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  33.91 
 
 
337 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  34.42 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  35.63 
 
 
338 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  35.73 
 
 
342 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  34.29 
 
 
367 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  37.94 
 
 
354 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  33.82 
 
 
342 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  33.33 
 
 
356 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  35.21 
 
 
336 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  34.64 
 
 
348 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  35.22 
 
 
354 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  35.81 
 
 
362 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  34.49 
 
 
354 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  31.61 
 
 
367 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  34.41 
 
 
356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  35.23 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  36.08 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  33.79 
 
 
335 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  37.97 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  33.79 
 
 
395 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  33.79 
 
 
395 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  30.87 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.92 
 
 
353 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  35.22 
 
 
351 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  34.95 
 
 
375 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  30.57 
 
 
335 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  34.93 
 
 
363 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  32.31 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  33.8 
 
 
382 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  34.17 
 
 
366 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  31.18 
 
 
357 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  34.9 
 
 
351 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  30.94 
 
 
391 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  33.11 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  27.46 
 
 
356 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  30.58 
 
 
346 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.97 
 
 
383 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  29.91 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  30.84 
 
 
379 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  33.77 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.9 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  28.57 
 
 
377 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  38.55 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  29.19 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  29.81 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  31.05 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  30.81 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  28.1 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  28.57 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  29.33 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  27.27 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  29.83 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  31.47 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.28 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  28 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  28.53 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  26.7 
 
 
397 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  27.61 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  26.38 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  26.86 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  33.77 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  30.97 
 
 
384 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  32.48 
 
 
403 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  27.57 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  28.45 
 
 
384 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  27.16 
 
 
436 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  29.46 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  30.26 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2813  acyltransferase family protein  29.83 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0036  acyltransferase family protein  29.83 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1730  acyltransferase family protein  29.83 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3164  acyltransferase family protein  29.83 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  33.99 
 
 
415 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  26.93 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  26.18 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  28.76 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  26.79 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  32.21 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  29.62 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5005  acyltransferase family protein  25.8 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3620  acyltransferase family protein  29.56 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.775575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  27.3 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3608  putative acyltransferase  29.56 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  22.42 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3633  putative acyltransferase  29.56 
 
 
372 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  26.07 
 
 
349 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  29.05 
 
 
366 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  24.08 
 
 
398 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  30.73 
 
 
403 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>