More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5005 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5005  acyltransferase family protein  100 
 
 		 336 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  28.69 
 
 		 604 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  26.07 
 
 		 598 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  27.37 
 
 		 679 aa  85.9  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28.33 
 
 		 660 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  24.6 
 
 		 603 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  24.6 
 
 		 603 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  26.42 
 
 		 640 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.99 
 
 		 604 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.99 
 
 		 604 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  28.9 
 
 		 583 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.18 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  25.13 
 
 		 690 aa  80.9  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  26.44 
 
 		 675 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 683 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  26.27 
 
 		 622 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  28.32 
 
 		 645 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.15 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  25.91 
 
 		 656 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  27.17 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.09 
 
 		 656 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  27.62 
 
 		 690 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  28.65 
 
 		 695 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  27.95 
 
 		 584 aa  77.8  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  27.3 
 
 		 695 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  26.96 
 
 		 695 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  26.78 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  25.67 
 
 		 673 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  26.5 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  27.86 
 
 		 657 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  24.85 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  25.29 
 
 		 691 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  27.82 
 
 		 696 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  24.79 
 
 		 641 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  24.66 
 
 		 621 aa  75.1  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  35.53 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  23.33 
 
 		 671 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  26.07 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  25.63 
 
 		 660 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  22.91 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  28.01 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.98 
 
 		 657 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  25.44 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  24.59 
 
 		 607 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  25.4 
 
 		 671 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  34.76 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.32 
 
 		 660 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  25.93 
 
 		 635 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  27.03 
 
 		 621 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.96 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  27.35 
 
 		 629 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  27.63 
 
 		 625 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  25.57 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  34.81 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  25.27 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  27.06 
 
 		 647 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  34.67 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.84 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  33.54 
 
 		 734 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  26.89 
 
 		 658 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.27 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  24.74 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  26.74 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  29.68 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  34.72 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  29.55 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  24.74 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  25.56 
 
 		 675 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  26.35 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  34.69 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  26.91 
 
 		 654 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  25.64 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  26.23 
 
 		 643 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  26.69 
 
 		 675 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  24.34 
 
 		 680 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  23.57 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  29.51 
 
 		 632 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  24.79 
 
 		 716 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  24.71 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  31.82 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.94 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  25.5 
 
 		 684 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  31.95 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.57 
 
 		 642 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  24.01 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  31.58 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  26.33 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.97 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  25.99 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  27.39 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  27.39 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  27.91 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  29.68 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  26.84 
 
 		 632 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  27.71 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  27.67 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.8 
 
 		 629 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  31.13 
 
 		 977 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  24.79 
 
 		 710 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>