270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3990 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
413 aa  801    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  46.31 
 
 
415 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  43.37 
 
 
424 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0809  acyltransferase 3  39.71 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  41.02 
 
 
439 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  38.5 
 
 
403 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  36.59 
 
 
403 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  34.25 
 
 
587 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  30.35 
 
 
435 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  33.16 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  33.16 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  33.92 
 
 
392 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  34.55 
 
 
394 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  35.04 
 
 
401 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  32 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  34.29 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  35.16 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  35.6 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  35.6 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  36.41 
 
 
396 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  36.41 
 
 
396 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  31.75 
 
 
561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  35.88 
 
 
404 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0417  acyltransferase 3  33.75 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  31.27 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  34.64 
 
 
396 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4285  acyltransferase 3  37.33 
 
 
421 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11280  acyltransferase  33.88 
 
 
383 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.795947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  33.6 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4464  acyltransferase 3  28.32 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  30.6 
 
 
376 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  29.49 
 
 
515 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1295  acyltransferase 3  41.82 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  29.74 
 
 
671 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  30 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  31.15 
 
 
635 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  23.83 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  28.86 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  31.52 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  28.89 
 
 
671 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  23.5 
 
 
607 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  27.78 
 
 
598 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2361  acyltransferases-like protein  43.44 
 
 
149 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115726  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  32.93 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  34.76 
 
 
358 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  24.13 
 
 
622 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  29.41 
 
 
398 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3031  acyltransferase 3  32.67 
 
 
438 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  22.44 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.76 
 
 
639 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  29.08 
 
 
675 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  23.73 
 
 
384 aa  61.6  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.46 
 
 
637 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.37 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  26.83 
 
 
635 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  24.87 
 
 
354 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25.25 
 
 
695 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  29.15 
 
 
671 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  30.54 
 
 
665 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  27.99 
 
 
630 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  36.54 
 
 
656 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.39 
 
 
629 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  33.12 
 
 
379 aa  60.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  29.35 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  28.96 
 
 
759 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  28.75 
 
 
645 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  25.45 
 
 
658 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  32.3 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  29.63 
 
 
671 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  21.72 
 
 
604 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  27.27 
 
 
583 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3648  acyltransferase 3  35.16 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  23.31 
 
 
640 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  21.72 
 
 
604 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3937  acyltransferase 3  32.92 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  26.14 
 
 
641 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  24.4 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.25 
 
 
656 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  29.52 
 
 
635 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.83 
 
 
679 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  24.74 
 
 
710 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  30.05 
 
 
734 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  24.74 
 
 
710 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  27.61 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  34.57 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  23.73 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.86 
 
 
642 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.72 
 
 
584 aa  57  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  29.19 
 
 
675 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  33.88 
 
 
448 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  25.43 
 
 
357 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  24.25 
 
 
396 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  26.09 
 
 
371 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  26.36 
 
 
684 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  28.09 
 
 
660 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  30.29 
 
 
660 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  30.34 
 
 
363 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  25.42 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  22.64 
 
 
605 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  26.19 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>