258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2826 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  100 
 
 
349 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  32.69 
 
 
437 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  35.14 
 
 
384 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  31.67 
 
 
369 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  32.41 
 
 
404 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  32.07 
 
 
415 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  32.36 
 
 
364 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  31.09 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  30.93 
 
 
396 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  29.8 
 
 
356 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0741  acyltransferase 3  30.67 
 
 
396 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387687  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  28.76 
 
 
389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  32.35 
 
 
243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  28.33 
 
 
366 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  28.23 
 
 
378 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  29.31 
 
 
363 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  30.08 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  28.5 
 
 
377 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  27.63 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  23.59 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  31.43 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  25.62 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.52 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  32.09 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  25.24 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  25.07 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1542  acyltransferase 3  25.61 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244939  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  24.64 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  25.27 
 
 
342 aa  63.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  29.94 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  22.59 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  30.43 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  26.4 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  25.91 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3866  acyltransferase 3  24.48 
 
 
379 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  25.43 
 
 
401 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  23.91 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  24.35 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  31.01 
 
 
368 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  34.81 
 
 
432 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  24.13 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  27.73 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  27.54 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  24.4 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  25.19 
 
 
383 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  27.74 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  24.04 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  31.14 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  24.93 
 
 
382 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  26.78 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  31.85 
 
 
420 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  25.11 
 
 
416 aa  55.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  28.1 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  26.13 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  36.57 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  26.13 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0557  acyltransferase 3  29.22 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.972582  normal  0.853179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  30.12 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  31.9 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  29.65 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  29.27 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  21.35 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  26.13 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25.16 
 
 
695 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  32.37 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  27.04 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  25.78 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  21.89 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  25.67 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  24.39 
 
 
391 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  27.74 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  29.67 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  22.48 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  29.65 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  26.15 
 
 
351 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  25.11 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  28.14 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  27.33 
 
 
367 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  26.56 
 
 
642 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4138  acyltransferase 3  29.21 
 
 
379 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  28.64 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4789  acyltransferase 3  29.21 
 
 
379 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3378  acyltransferase 3  29.21 
 
 
379 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  23.8 
 
 
346 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  28.85 
 
 
383 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  22.97 
 
 
359 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2850  acyltransferase 3  29.5 
 
 
379 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3937  acyltransferase 3  27.44 
 
 
406 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  30.77 
 
 
399 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  26.05 
 
 
333 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  27.22 
 
 
625 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  29.7 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  24.11 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  29.34 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  30.95 
 
 
374 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  27.27 
 
 
357 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  28.21 
 
 
344 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1666  acyltransferase 3  25 
 
 
339 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  25.14 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  25.43 
 
 
604 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>