83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1470 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  100 
 
 
376 aa  757    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  33.14 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  32.75 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  30.81 
 
 
373 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  31.21 
 
 
371 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  31.46 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  31.34 
 
 
371 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  33.33 
 
 
358 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  31.9 
 
 
386 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  29.26 
 
 
368 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  29.4 
 
 
379 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  29.81 
 
 
369 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  29.53 
 
 
369 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  28.9 
 
 
410 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  28.61 
 
 
358 aa  99  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  27.95 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  27.64 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  31.71 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  27.64 
 
 
391 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  28.64 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  28.64 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  28.64 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  28.64 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  28.64 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  27.43 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  31.34 
 
 
358 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  29.85 
 
 
336 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  31.79 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  28.31 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
714 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  26.03 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  27.9 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  28.39 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  28.39 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  26.58 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  30.98 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  28.8 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  30.03 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  28.08 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  29.18 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  36.84 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  29.55 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  27.11 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  29.57 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  30.6 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  32.92 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  26.08 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  27.49 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  27.1 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  25.72 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  27.98 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  29.37 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  33.33 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  28.1 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  29.3 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  25.58 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  25.58 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  27.04 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  37.97 
 
 
378 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.45 
 
 
343 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  31.21 
 
 
392 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  31.21 
 
 
392 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  29.94 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  27.67 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5485  acyltransferase 3  27.27 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  27.98 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  26.75 
 
 
366 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  30.52 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  29.11 
 
 
359 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  42.55 
 
 
564 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  27.41 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  29.22 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  28.86 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  26.01 
 
 
352 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  25.62 
 
 
657 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  31.68 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  25.62 
 
 
657 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0727  acyltransferase-like protein  27.45 
 
 
389 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  28.57 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  30.16 
 
 
378 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  26.86 
 
 
415 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  27.91 
 
 
351 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  24.55 
 
 
358 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>