93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2337 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  100 
 
 
401 aa  780    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  63.84 
 
 
478 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  46.26 
 
 
416 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  40 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  32.32 
 
 
412 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  32.11 
 
 
412 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  32.11 
 
 
412 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  32.11 
 
 
412 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  32.58 
 
 
412 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  32.58 
 
 
412 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  31.85 
 
 
412 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  31.85 
 
 
412 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  32.88 
 
 
467 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  31.11 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  32.53 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  33.33 
 
 
367 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  33.02 
 
 
376 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  27.79 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
714 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  31.14 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  28.06 
 
 
350 aa  93.2  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  34.38 
 
 
358 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  29.97 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  33.24 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  26.67 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  27.54 
 
 
363 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  31.23 
 
 
358 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  27.86 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  27.65 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  28.72 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  28.61 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  30.96 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  28.77 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  29.21 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  26.96 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  27.51 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  26.58 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  26.38 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  27.48 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  31.62 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  26.69 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  30.85 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  25.81 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  26.91 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  31.4 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  27.22 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  25.07 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  27.78 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  28.2 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  29.68 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  28.45 
 
 
336 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  27.11 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  26.2 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  31.27 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  25.43 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  26.12 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  30.94 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  40.43 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  29.44 
 
 
384 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  34.23 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  25.73 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  27.82 
 
 
335 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  30.25 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  32.14 
 
 
404 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  39.64 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  33.85 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  28.91 
 
 
436 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  29.1 
 
 
318 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1542  acyltransferase 3  33.09 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  37.4 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  28.57 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  34.78 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  30.6 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  31.14 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  31.14 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  31.14 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  28.77 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.37 
 
 
359 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0719  acyltransferase-like protein  28.63 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.838666  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  35.56 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  37.89 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  30.28 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  50 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0955  acyltransferase 3  32.58 
 
 
402 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  42.31 
 
 
346 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  37.63 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0973  acyltransferase 3  32.58 
 
 
402 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  26.59 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  24.26 
 
 
715 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  32.35 
 
 
673 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  29.15 
 
 
713 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  35.62 
 
 
342 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  33.73 
 
 
360 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>