83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0728 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  100 
 
 
396 aa  774    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0741  acyltransferase 3  96.97 
 
 
396 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387687  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  40.25 
 
 
389 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  37.2 
 
 
378 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  32.63 
 
 
381 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  30.67 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  31.35 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  39.52 
 
 
243 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  26.29 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  32.56 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  35.9 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  27.69 
 
 
415 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  27.02 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  29.41 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3866  acyltransferase 3  25.41 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  28.34 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  31.45 
 
 
337 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  28.25 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.12 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  30.99 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  34.43 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  29.19 
 
 
340 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  28.17 
 
 
309 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  28.46 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.83 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.48 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  28 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  30.86 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  33.08 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  33.54 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  29.11 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  26.7 
 
 
348 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  29.15 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  21.97 
 
 
363 aa  53.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  29.11 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  24.19 
 
 
603 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  24.19 
 
 
603 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  32.67 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  28.57 
 
 
366 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  32.97 
 
 
377 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  28.26 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  34.68 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  28.67 
 
 
340 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  32.35 
 
 
354 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  33.87 
 
 
351 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  30.06 
 
 
367 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  35.48 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  29.89 
 
 
602 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  30.04 
 
 
410 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  27.99 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  30.04 
 
 
401 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  35.48 
 
 
344 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  32.53 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  34.95 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  28.82 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  28.7 
 
 
695 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  29.17 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15660  predicted acyltransferase  21.52 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  28.86 
 
 
366 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  30.95 
 
 
603 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28.28 
 
 
384 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3937  acyltransferase 3  29.89 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  34.65 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  28.74 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  30.48 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  28.23 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  27.19 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  35.29 
 
 
346 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  28.4 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  31.25 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  27.52 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  27.98 
 
 
430 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  28.21 
 
 
354 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  31.52 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  33.01 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  32.23 
 
 
478 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  29.33 
 
 
410 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  31.06 
 
 
351 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  29.94 
 
 
358 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  28.87 
 
 
353 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  31.37 
 
 
362 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  28.8 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  32.08 
 
 
351 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>