67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0478 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  100 
 
 
368 aa  730    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  31.87 
 
 
350 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  30.79 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  29.27 
 
 
377 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  33.24 
 
 
358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  32.89 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  30.09 
 
 
358 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  33.72 
 
 
378 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
714 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  29.97 
 
 
358 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  30.4 
 
 
386 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  28 
 
 
389 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  30.31 
 
 
371 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  30.57 
 
 
371 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  28.89 
 
 
379 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  29.34 
 
 
376 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  30.03 
 
 
360 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  32.29 
 
 
360 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  29.25 
 
 
351 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  29.88 
 
 
416 aa  96.3  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  31.85 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  31.16 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  27.55 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  28.41 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  29.37 
 
 
412 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  29.37 
 
 
412 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  30.92 
 
 
374 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  29.84 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  29.84 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  29.84 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  29.07 
 
 
399 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  30.26 
 
 
367 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  26.36 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  26.88 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  29.58 
 
 
412 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  27.3 
 
 
369 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  32.02 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  29.58 
 
 
412 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  27.91 
 
 
318 aa  89.4  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  29.17 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  28.73 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  26.82 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  31.59 
 
 
321 aa  86.7  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  27.37 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  28.17 
 
 
467 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  27.68 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  27.9 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  27.09 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  29.21 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  28.87 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  26.49 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  28.01 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  26.88 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  28.98 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25760  predicted acyltransferase  26.52 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  26.3 
 
 
367 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  28.61 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  26.86 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  26.86 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  28.7 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  26.44 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0220  hypothetical protein  28.28 
 
 
201 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152958  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2235  hypothetical protein  36.89 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  27.61 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  25 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  25.62 
 
 
638 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  23.81 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>