125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6949 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  100 
 
 
478 aa  929    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  63.84 
 
 
401 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  46.55 
 
 
416 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  38.42 
 
 
378 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  34.32 
 
 
467 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  32.51 
 
 
412 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  32.51 
 
 
412 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  32.51 
 
 
412 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  32.51 
 
 
412 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  32.51 
 
 
412 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  31.97 
 
 
412 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  32.24 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  32.24 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  34.02 
 
 
380 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  35.61 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  35.67 
 
 
376 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 
714 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  30.14 
 
 
377 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  30.92 
 
 
363 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  35.74 
 
 
367 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  31.36 
 
 
371 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  37.5 
 
 
358 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  29.38 
 
 
389 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  29.45 
 
 
350 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  30.29 
 
 
358 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  28.57 
 
 
358 aa  100  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  32.68 
 
 
373 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  29.94 
 
 
371 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  29.31 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  33.33 
 
 
360 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  29.81 
 
 
369 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  29.17 
 
 
369 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  30.97 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  27.92 
 
 
370 aa  92.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  34.2 
 
 
360 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  28.61 
 
 
363 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  34.48 
 
 
361 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  31.61 
 
 
386 aa  87.8  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  28.77 
 
 
376 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  27.32 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  30 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  28.96 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  27.86 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  27.2 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  30.66 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  25.81 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  29.94 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  29.91 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  26.36 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  28.21 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  29.03 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  27.17 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  29.74 
 
 
343 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  27.15 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  26.42 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  28.22 
 
 
318 aa  66.6  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  26.56 
 
 
367 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  27.07 
 
 
349 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  27.53 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  28.94 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  28.94 
 
 
365 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  29.26 
 
 
384 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  30.27 
 
 
395 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  24.04 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  25.81 
 
 
676 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  38.05 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  23.74 
 
 
657 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  40.58 
 
 
432 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  26.15 
 
 
690 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  30.46 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  48.28 
 
 
385 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  36 
 
 
713 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  28.7 
 
 
339 aa  50.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  31.18 
 
 
376 aa  50.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  34.31 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  36.36 
 
 
402 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  27.89 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  35.05 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  26.15 
 
 
710 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0955  acyltransferase 3  35.23 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  27.06 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  25.75 
 
 
437 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  26.15 
 
 
710 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0973  acyltransferase 3  35.23 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  50 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  31.78 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1542  acyltransferase 3  37.25 
 
 
370 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244939  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  27.43 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  28.82 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  29.29 
 
 
448 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  29.26 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  31.32 
 
 
243 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  29.94 
 
 
383 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  36 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  42.65 
 
 
340 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  36.56 
 
 
384 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0220  hypothetical protein  32.84 
 
 
201 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152958  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  26.01 
 
 
688 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  28.81 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  22.33 
 
 
639 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>