167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3255 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  100 
 
 
364 aa  723    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  32.07 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  28.89 
 
 
437 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  30.79 
 
 
415 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  30.15 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  30.36 
 
 
404 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  30.21 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  36.09 
 
 
243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  27.65 
 
 
415 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  31.53 
 
 
366 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  29.26 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  28.62 
 
 
389 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  30.22 
 
 
381 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  35.43 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3866  acyltransferase 3  28.34 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  33.33 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  35.09 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0741  acyltransferase 3  32.56 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  32.56 
 
 
396 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  20.9 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.67 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  25.75 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  20.9 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  26.56 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  30.12 
 
 
383 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  31.9 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  28.93 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  25.68 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  29.27 
 
 
432 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  40 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  27.94 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  33.15 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  23.1 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.78 
 
 
393 aa  56.2  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  22.94 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2813  acyltransferase family protein  30.77 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0036  acyltransferase family protein  30.77 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1730  acyltransferase family protein  30.77 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3164  acyltransferase family protein  30.77 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  23.42 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  27.38 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  37.65 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3620  acyltransferase family protein  30.59 
 
 
400 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.775575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  30.59 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  27.98 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  31.08 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3608  putative acyltransferase  30.77 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3633  putative acyltransferase  30.77 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  34.12 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.58 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  32.24 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  28.44 
 
 
352 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  26.75 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  24.1 
 
 
340 aa  53.1  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  30.52 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  26.94 
 
 
385 aa  52.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  29.88 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  23.37 
 
 
344 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  29.25 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  29.7 
 
 
348 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  31.17 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  25.45 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  34.07 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0557  acyltransferase 3  36.26 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.972582  normal  0.853179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  30.68 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  30.17 
 
 
362 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  27.39 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  31.62 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  24.51 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  26.02 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  21.26 
 
 
401 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  21.26 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  34.09 
 
 
378 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  29.41 
 
 
357 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.98 
 
 
378 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  29.38 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  30.52 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  24.21 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.45 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  27 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  29.49 
 
 
564 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  22.12 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  23.12 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  30.15 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  28.19 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  30.15 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  30.64 
 
 
454 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  30.15 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  30.15 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  21.91 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  30.15 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  29.63 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  31.11 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  32.97 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  25.5 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  25.5 
 
 
397 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  25.5 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  25.15 
 
 
387 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  31.22 
 
 
362 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  26 
 
 
397 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>