More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1849 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  100 
 
 		 454 aa  917    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.81 
 
 		 386 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.51 
 
 		 616 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  31.07 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  26.68 
 
 		 671 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  31.25 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 660 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  34.63 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.42 
 
 		 660 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  34.66 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  34.63 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  34.63 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  23.19 
 
 		 603 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  32.35 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  29.61 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  26.97 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  25.92 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  25.4 
 
 		 641 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  23.15 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  33.67 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  25.91 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  35.03 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  29.14 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  27.29 
 
 		 683 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  24.76 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  32.99 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  25.64 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  31.63 
 
 		 660 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  24.12 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  25.93 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  27.42 
 
 		 977 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  24.35 
 
 		 671 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  35.03 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.18 
 
 		 660 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  25.2 
 
 		 394 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  31.21 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  28.29 
 
 		 598 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  29.73 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  32.95 
 
 		 584 aa  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  32.02 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  26.1 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  29.8 
 
 		 671 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  35.03 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  25.71 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  35.03 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  30.51 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.58 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  33.73 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  29.33 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  29.17 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  24.62 
 
 		 656 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  39.22 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  29.55 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  34.59 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  26.02 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  31.96 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  30.77 
 
 		 607 aa  62  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  32.78 
 
 		 603 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  32.78 
 
 		 603 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  31.46 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  33.73 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  25.94 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  34.29 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  24.53 
 
 		 621 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  23.3 
 
 		 690 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  28.06 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  24.08 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  30.77 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  32.12 
 
 		 679 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  30.21 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  29.79 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  31.32 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  27.4 
 
 		 734 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  27.33 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  26.34 
 
 		 684 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  29.3 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  31.18 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  30.64 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0487  acyltransferase 3  38.68 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.64 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  31.32 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  33.15 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  30.64 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  26.11 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  30.23 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  29.12 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  30.16 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  27.54 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  29.5 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  27.91 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  28.49 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  30.12 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  33.56 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  29.14 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  33.54 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  23.27 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  32.22 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  30.85 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>