77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3866 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3866  acyltransferase 3  100 
 
 
379 aa  764    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  30.83 
 
 
385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  27.99 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  28.53 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  26.13 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  40.35 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  29.08 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  39.6 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  23.71 
 
 
349 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  25.48 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  26.57 
 
 
394 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  33.1 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  24.86 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  29.83 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  25.49 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  24.42 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  22.75 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  27.6 
 
 
437 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  24.37 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  34.65 
 
 
415 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.97 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15660  predicted acyltransferase  23.81 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  25 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  26.65 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  28.3 
 
 
351 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  30.23 
 
 
367 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  30.39 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  33.64 
 
 
354 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  27.08 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  24.93 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  39.5 
 
 
432 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  26.76 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.93 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  26.46 
 
 
368 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  34.45 
 
 
351 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  25.97 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0741  acyltransferase 3  25.16 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387687  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  25.89 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  25.89 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  29.63 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  25.77 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  32.8 
 
 
561 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  26.82 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
714 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5002  acyltransferase family protein  25.07 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  27.04 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  30.29 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  30.3 
 
 
389 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  23.44 
 
 
384 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  27.87 
 
 
378 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  27.31 
 
 
398 aa  46.2  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  33 
 
 
404 aa  46.2  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  29.63 
 
 
356 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  28.31 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  25.92 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  23.92 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  32.77 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  33.04 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  31.25 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  25.08 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  26.4 
 
 
478 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  35.78 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  28.65 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  32.77 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  32.77 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  30.43 
 
 
587 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  28.02 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  23.93 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  22.02 
 
 
398 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  26.2 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  26.33 
 
 
374 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  22.44 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  32.74 
 
 
335 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  33.88 
 
 
309 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  22.94 
 
 
382 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  29.85 
 
 
354 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  23.08 
 
 
409 aa  42.7  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>