46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5002 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5002  acyltransferase family protein  100 
 
 		 362 aa  726    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1185  acyltransferase 3  37.25 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1175  acyltransferase 3  33.52 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1666  acyltransferase 3  29.53 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3994  acyltransferase 3  31.13 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2081  putative acyltransferase  26.75 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00181822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3104  acyltransferase 3  27.37 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1542  acyltransferase 3  27.11 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  30.41 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 714 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  22.66 
 
 		 647 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  30.06 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  22.66 
 
 		 629 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.81 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  28.86 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  30.26 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  25.19 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  23.22 
 
 		 681 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0298  acyltransferase 3  26.48 
 
 		 603 aa  49.7  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.613325  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  22.52 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  28.81 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  21.98 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  22.95 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  26.47 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  21.83 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  22.79 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.39 
 
 		 359 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  28.65 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  24.04 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  23.04 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  25.8 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  23.14 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  25.56 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  24.17 
 
 		 629 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  26.1 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6251  acyltransferase 3  26.92 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  31.4 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  23.37 
 
 		 662 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  29.17 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  23.19 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  22.97 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  23.27 
 
 		 658 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  24.64 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  28.78 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  34.94 
 
 		 352 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>