56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1185 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1185  acyltransferase 3  100 
 
 		 352 aa  713    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5002  acyltransferase family protein  37.25 
 
 		 362 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1666  acyltransferase 3  34.46 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1175  acyltransferase 3  34.25 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3994  acyltransferase 3  31.18 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3104  acyltransferase 3  28.29 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2081  putative acyltransferase  25.2 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00181822  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  24.24 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  31.11 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  26.63 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1542  acyltransferase 3  24.45 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  25.32 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  23.62 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  27.81 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  26.29 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  23.51 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  28.43 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  23.81 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  23.04 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0892  acyltransferase family protein  23.08 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000392602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  23.89 
 
 		 337 aa  49.7  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  27.39 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  31.76 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  23.64 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  29.68 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6251  acyltransferase 3  29.03 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  23.2 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  25.29 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  21.1 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  22.47 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  33.71 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  28.87 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  20.83 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  39.53 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1295  acyltransferase 3  30 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  32.58 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  24.28 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  20.83 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  22.4 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  30.68 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  22.91 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  27.02 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  27.32 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  22.88 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  24.53 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  22.53 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  20.7 
 
 		 528 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  35 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  27.03 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  25.97 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  28.23 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  25.81 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  24.14 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  24.23 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  21.12 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>