159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1937 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  100 
 
 
369 aa  738    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  31.67 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  30.19 
 
 
404 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  29.14 
 
 
364 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  29.91 
 
 
378 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  28.29 
 
 
415 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  28.17 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  30.53 
 
 
356 aa  92.8  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  27.27 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  35.96 
 
 
243 aa  90.5  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  29.68 
 
 
381 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  28.53 
 
 
389 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0741  acyltransferase 3  31.19 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387687  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  28 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  31.35 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  24.03 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  27.61 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.67 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  29.47 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.13 
 
 
660 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.37 
 
 
658 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3866  acyltransferase 3  28.61 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5485  acyltransferase 3  24.62 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  27.86 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.16 
 
 
662 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  36.24 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  27.65 
 
 
621 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  27.06 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  33.33 
 
 
665 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  30.32 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  23.93 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  29.26 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  30.77 
 
 
734 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1392  acyltransferase 3  25.44 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.82 
 
 
681 aa  53.9  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  28.57 
 
 
404 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  29.55 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2813  acyltransferase family protein  29.78 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  32 
 
 
641 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0036  acyltransferase family protein  29.78 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1730  acyltransferase family protein  29.78 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3164  acyltransferase family protein  29.78 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3633  putative acyltransferase  29.47 
 
 
372 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3620  acyltransferase family protein  28.93 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.775575  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1185  acyltransferase 3  23.51 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3608  putative acyltransferase  29.47 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  32.14 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  26.55 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  32.6 
 
 
777 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.88 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  27.05 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  26.97 
 
 
640 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2879  hypothetical protein  22.01 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  32.32 
 
 
348 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  30.43 
 
 
602 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  25.93 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  29.59 
 
 
656 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  33.33 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  25.93 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  25.93 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  36.7 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  31.28 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  27.84 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  27.69 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  31.45 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  32.32 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  28.67 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.94 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  34.31 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  26.55 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  27.91 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  25.98 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  24.79 
 
 
369 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  26.27 
 
 
629 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  23.89 
 
 
637 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  34.26 
 
 
383 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  26.83 
 
 
584 aa  46.6  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  26.78 
 
 
651 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  25.15 
 
 
362 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15660  predicted acyltransferase  22.35 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  25.87 
 
 
647 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  32.33 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  30.25 
 
 
377 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  29.41 
 
 
378 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  27.75 
 
 
372 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  34.18 
 
 
671 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.37 
 
 
695 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  34.26 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  29.05 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  29.23 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  32.32 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  29.07 
 
 
742 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  26.22 
 
 
660 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  28.66 
 
 
635 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  30.86 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  30.12 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  25.07 
 
 
684 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  31.65 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  32.67 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  27.17 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>