134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1329 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  100 
 
 
376 aa  745    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  32.32 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  32.7 
 
 
363 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  32.41 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  33.71 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  29.49 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  37.12 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  36.57 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  32.88 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  32.1 
 
 
368 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  31.7 
 
 
386 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  33.6 
 
 
358 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  33.55 
 
 
360 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  34.68 
 
 
478 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  32.94 
 
 
387 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  31.92 
 
 
378 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  29.82 
 
 
371 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  29.41 
 
 
371 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  29.7 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  31.83 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  30.84 
 
 
351 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  39.63 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  30 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  32.77 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  28.61 
 
 
408 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  27.35 
 
 
369 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  28.29 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  28.5 
 
 
399 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  33.55 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  27.53 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  28.23 
 
 
412 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  28.92 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  28.92 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  28.92 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  28.38 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  28.38 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  27.37 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  28.65 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  28.65 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  26.86 
 
 
321 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  28.81 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  24.19 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  26.6 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  25.92 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  29.63 
 
 
339 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  28.53 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  25.55 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  28.42 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  28.07 
 
 
370 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  33.98 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  33.61 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  30.09 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
714 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  29.93 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  26.4 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  25.63 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  32.92 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  29.36 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  26.5 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  28.41 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  29.08 
 
 
384 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  26.43 
 
 
410 aa  57.4  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.04 
 
 
657 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  23.84 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  23.87 
 
 
371 aa  53.1  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  34.55 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  29.29 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  25 
 
 
383 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.04 
 
 
657 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  26.59 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  33.33 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  25.92 
 
 
338 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  26.47 
 
 
366 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  28.08 
 
 
423 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  28.21 
 
 
346 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  36.56 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  28.96 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  31.45 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  21.99 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.82 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  29 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  27.58 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  27.12 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  21.7 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  21.7 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  31.3 
 
 
665 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  29.84 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.89 
 
 
616 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  30.73 
 
 
675 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  32.58 
 
 
330 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  22.58 
 
 
397 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  28.7 
 
 
358 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  34.69 
 
 
660 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  23.61 
 
 
377 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  25.65 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  35.34 
 
 
690 aa  46.6  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  27.17 
 
 
389 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  28.37 
 
 
716 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.2 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  27.54 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>