65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0178 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  100 
 
 
369 aa  714    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  49.57 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3984  acyltransferase 3  48.97 
 
 
363 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0589  acyltransferase 3  49.56 
 
 
363 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3370  acyltransferase 3  42.86 
 
 
370 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2295  acyltransferase 3  43.05 
 
 
387 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.976705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2806  acyltransferase 3  42.78 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  38.36 
 
 
362 aa  210  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2401  acyltransferase 3  41.08 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3139  acyltransferase 3  42.74 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.586381  normal  0.0112196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2122  acyltransferase 3  41.41 
 
 
367 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2172  acyltransferase 3  40.27 
 
 
393 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219219  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  25.52 
 
 
344 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  25.14 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0119  hypothetical protein  20.74 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0158514  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  36.05 
 
 
409 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  24.12 
 
 
675 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  22.95 
 
 
603 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  22.95 
 
 
603 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  28.93 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  23.64 
 
 
683 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  23.01 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  34.91 
 
 
629 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  27.45 
 
 
389 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  34.91 
 
 
629 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  24.93 
 
 
415 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  34.95 
 
 
647 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  20.05 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0104  hypothetical protein  21.67 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.402195  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2098  acyltransferase 3  25.15 
 
 
682 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  22.48 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  25.98 
 
 
690 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  36.51 
 
 
710 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  25.51 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  20.18 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  21.65 
 
 
640 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  24.26 
 
 
662 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  27.27 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  20.18 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  26.71 
 
 
404 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  25.13 
 
 
660 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  25.73 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  25.14 
 
 
657 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  26.13 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  26.13 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  22.39 
 
 
403 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  21.68 
 
 
639 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  29.34 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  25.2 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  20.48 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  24.72 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1867  acyltransferase-like protein  25.77 
 
 
397 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0282967  hitchhiker  0.0000000000000352917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  22.4 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  23.51 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  22.38 
 
 
362 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0530  acyltransferase 3  26.84 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0289106  hitchhiker  0.0000187982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  37.5 
 
 
656 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  21.38 
 
 
604 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  21.38 
 
 
604 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  41.67 
 
 
435 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.04 
 
 
377 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  24.52 
 
 
395 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  24.52 
 
 
395 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  25 
 
 
638 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  22.19 
 
 
369 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>