252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0149 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  100 
 
 
362 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  29.06 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  26.25 
 
 
437 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  29.32 
 
 
400 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  37.5 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  25.71 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  28.35 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  23.16 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  26.33 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  24.6 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  25.46 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.26 
 
 
386 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  23.48 
 
 
392 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  23.48 
 
 
392 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  27.61 
 
 
640 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.47 
 
 
660 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  26.02 
 
 
658 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  30.26 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  28.31 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  27.33 
 
 
454 aa  60.1  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  30.92 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  24.52 
 
 
583 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  24.65 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  29.68 
 
 
380 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  29.19 
 
 
380 aa  59.7  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  25.39 
 
 
658 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  29.48 
 
 
696 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  29.75 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  28.74 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.21 
 
 
660 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  29.65 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  27.88 
 
 
584 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  23.9 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  29.75 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  26.32 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  29.75 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  24.67 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  24.3 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  28.8 
 
 
379 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  28.74 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  25.47 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  26.67 
 
 
695 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  27.33 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  30.19 
 
 
362 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.33 
 
 
656 aa  57  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.41 
 
 
679 aa  57  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  28.65 
 
 
366 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  28.21 
 
 
397 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  27.39 
 
 
415 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  25.64 
 
 
354 aa  56.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  26.27 
 
 
398 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  24.3 
 
 
675 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  29.87 
 
 
377 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  29.24 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  25.76 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  27.16 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  30.26 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  29.34 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  25.65 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  23.75 
 
 
392 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  23.47 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  24.55 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  24.46 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  28.3 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  29.81 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  24.52 
 
 
660 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  30.08 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  27.81 
 
 
403 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  30.28 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  29.49 
 
 
396 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  30.19 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  28.21 
 
 
622 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  24.93 
 
 
383 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  27.5 
 
 
376 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  28.12 
 
 
376 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  30.19 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  25.71 
 
 
358 aa  52.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3552  acyltransferase 3  23.26 
 
 
382 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  23.69 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  24.07 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  23.91 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  26.35 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  22.39 
 
 
642 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  21.71 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  20.23 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  31.01 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.91 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  23.89 
 
 
629 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  21.67 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  25.56 
 
 
647 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  30.97 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  29.03 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  21.73 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  28.99 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  25.27 
 
 
635 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  29.45 
 
 
397 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  22.82 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  29.49 
 
 
354 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  28.99 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>