140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1095 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  100 
 
 		 381 aa  764    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  30.6 
 
 		 376 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  30.93 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0124  acyltransferase 3  26.65 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  26.9 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  23.14 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  26.1 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  29.02 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  21.95 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  24.5 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  24.64 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  24.64 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.04 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  23.99 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  24.65 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.35 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  22.83 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  23.1 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  22.83 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  22.83 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  32.96 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  23.56 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  27.55 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  27.13 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  26.97 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0557  acyltransferase 3  23.91 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.972582  normal  0.853179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  22.14 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  22.69 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  28.21 
 
 		 658 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  23.19 
 
 		 603 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  28.21 
 
 		 658 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  22.4 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  23.03 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  20.23 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4185  acyltransferase 3  25.73 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  23.56 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  23 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2569  acyltransferase 3  24.46 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  27.42 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  25.15 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1765  acyltransferase 3  23.4 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  37.62 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  22.48 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  22 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  20.64 
 
 		 657 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  20.91 
 
 		 657 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  23.82 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  26.74 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2263  acyltransferase 3  25.29 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  25.97 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  26.6 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  25.74 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  23.68 
 
 		 592 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  24.92 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  23.04 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.85 
 
 		 640 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  24.58 
 
 		 760 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  23.01 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  28.11 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  30.87 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  31.68 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  29.07 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  21.88 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  31.82 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  23.64 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  28.25 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  26.09 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  24.5 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  22.57 
 
 		 684 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  22.36 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 671 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  22.22 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  23.67 
 
 		 583 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  23.38 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  24.61 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  24.8 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  24.01 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  27.04 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  27.51 
 
 		 632 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  23.68 
 
 		 634 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  34.44 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  22.33 
 
 		 681 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  28.98 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  22.18 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  24.62 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  22.22 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  28.41 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  28.41 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  40.51 
 
 		 361 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  28.41 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  30.07 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  24.74 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  40.48 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  23.48 
 
 		 378 aa  46.2  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  24.17 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  27.41 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  25.52 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>