189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2268 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  100 
 
 
396 aa  801    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  25.32 
 
 
398 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  25.71 
 
 
362 aa  86.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  24.87 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  26.9 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  26.69 
 
 
662 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.25 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  26.67 
 
 
632 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  25.76 
 
 
660 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  25.06 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  25.68 
 
 
629 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  25.41 
 
 
383 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  23.62 
 
 
433 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  23.77 
 
 
639 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  26.52 
 
 
660 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  23.92 
 
 
350 aa  63.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  25.57 
 
 
642 aa  63.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  26.56 
 
 
690 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  24.39 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  23.87 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  25 
 
 
353 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  21.57 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.07 
 
 
660 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  22.39 
 
 
369 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  24.55 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  28.04 
 
 
397 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  23.26 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.42 
 
 
616 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  27.69 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  24.43 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  27.69 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  23.76 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  27.69 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  24.76 
 
 
656 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  28.44 
 
 
695 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  25.77 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  23.51 
 
 
366 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  26.88 
 
 
364 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  25.23 
 
 
645 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  25.7 
 
 
598 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  30.34 
 
 
404 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  28.77 
 
 
652 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  26.38 
 
 
607 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  22.77 
 
 
640 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  26.48 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  27.62 
 
 
696 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  23.48 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  23.17 
 
 
622 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  25.61 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  21.82 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  27.3 
 
 
665 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  29.19 
 
 
641 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  27.43 
 
 
604 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  27.13 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  21.82 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  23.36 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  28.19 
 
 
368 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  29.47 
 
 
587 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.08 
 
 
695 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  26.57 
 
 
667 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  26.67 
 
 
673 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  23.15 
 
 
583 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  25 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  26.4 
 
 
683 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  25.82 
 
 
615 aa  53.5  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  22.89 
 
 
760 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  36.36 
 
 
376 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  23.56 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  24.47 
 
 
635 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  21.27 
 
 
436 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  25.21 
 
 
675 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  22.95 
 
 
389 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  26.73 
 
 
681 aa  52.8  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  24.33 
 
 
690 aa  53.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  28.95 
 
 
437 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  23.96 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  25.23 
 
 
658 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  27.44 
 
 
662 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  25.77 
 
 
637 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  21.64 
 
 
395 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  24.22 
 
 
390 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  23.9 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  23.54 
 
 
660 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  33.67 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.9 
 
 
634 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  21.64 
 
 
395 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  23.71 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  27.66 
 
 
405 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  28.06 
 
 
690 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  23.1 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  24.92 
 
 
603 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.82 
 
 
603 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.82 
 
 
603 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  26.52 
 
 
435 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  25 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  26.22 
 
 
383 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.68 
 
 
679 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  24.3 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  24.61 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  25.63 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>