122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0180 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  100 
 
 
371 aa  749    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  34.9 
 
 
349 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  35.46 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  31.66 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  29.51 
 
 
419 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  31.78 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  24.94 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  27.98 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  26.02 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  28.44 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  32.94 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  28.52 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  27.27 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  24.04 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  29.65 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  35.23 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  24.7 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  24.7 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  24.7 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  25.8 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  26.92 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2651  acyltransferase 3  30.84 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  32.95 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  25.94 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  24.7 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.09 
 
 
371 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  27.95 
 
 
393 aa  63.5  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  31.03 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  31.28 
 
 
352 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25.14 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  26.44 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  34.83 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  27.36 
 
 
365 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  26.27 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0034  acyltransferase 3  27.55 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  27.97 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  25.74 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  26.58 
 
 
353 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.17 
 
 
354 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  26.71 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  25.88 
 
 
362 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  27.13 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  29.69 
 
 
433 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  23.33 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  24.12 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  35.25 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  27.36 
 
 
356 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  23.14 
 
 
448 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  24.55 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  38.55 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  35.33 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  31.08 
 
 
358 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  24.09 
 
 
422 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  24.02 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  31.82 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0593  acyltransferase 3  25.26 
 
 
339 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  26.24 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  25.59 
 
 
395 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  41.18 
 
 
353 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  27.91 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  30.14 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  32.16 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  28.77 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  29.69 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0023  hypothetical protein  26.01 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0020  hypothetical protein  26.01 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  24.48 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  28.75 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  27.54 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  23.87 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  22.39 
 
 
394 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  21.84 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  25.97 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  28.36 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  33.85 
 
 
478 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  27.54 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  30.43 
 
 
713 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  22.31 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  23.83 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  32.24 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  25.43 
 
 
346 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  23.19 
 
 
350 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  25.99 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  26.88 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  26.48 
 
 
340 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  28.32 
 
 
367 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  29.14 
 
 
348 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  29.84 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  27.87 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  24.69 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  26.04 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  23.14 
 
 
598 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  23.66 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  24.7 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25.3 
 
 
695 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  28.05 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  29.22 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  24.62 
 
 
662 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  23.88 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  28.37 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>