170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1748 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  100 
 
 
346 aa  694    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  47.83 
 
 
352 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  47.11 
 
 
376 aa  296  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  44.75 
 
 
382 aa  293  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  44.6 
 
 
374 aa  282  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  42.62 
 
 
377 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  43.93 
 
 
378 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  40.81 
 
 
370 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  41 
 
 
393 aa  256  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  41.16 
 
 
370 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  40.97 
 
 
398 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  39.71 
 
 
361 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  33.24 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  31.41 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  31.86 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  30.77 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  30.51 
 
 
368 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  29.49 
 
 
372 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  27.7 
 
 
363 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  29.13 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  27.51 
 
 
389 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  27.25 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0531  acyltransferase 3  26.75 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1939  acyltransferase 3  29.32 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  28.42 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  28.21 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  28.06 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  28.24 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
714 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  27.78 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  27.52 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  27.52 
 
 
419 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  23.97 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  26.79 
 
 
371 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  26.63 
 
 
478 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  37.36 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  25.75 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  28.21 
 
 
376 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  29.08 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  34.97 
 
 
433 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  23.62 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  44.44 
 
 
399 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  26.32 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  43.33 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  25.59 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  25.59 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  25.59 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  25.73 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  24.86 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  23.59 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  25.45 
 
 
436 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.07 
 
 
371 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  25.38 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  24.3 
 
 
584 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  30.86 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  26.03 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  26.89 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  29.59 
 
 
528 aa  52.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  26.5 
 
 
635 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  40.43 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  26.4 
 
 
356 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  24.86 
 
 
339 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  24.33 
 
 
389 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  25.52 
 
 
395 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  24.26 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  23.56 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  39.58 
 
 
353 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  36.05 
 
 
690 aa  50.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  25.14 
 
 
632 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  32.63 
 
 
592 aa  49.7  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  29.58 
 
 
352 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  24.16 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  25.53 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  26.39 
 
 
716 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  23.88 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  29.68 
 
 
598 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  23.88 
 
 
667 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.24 
 
 
660 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0557  acyltransferase 3  28.18 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.972582  normal  0.853179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  25.86 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  25.13 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  39.74 
 
 
695 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  30.82 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  25.75 
 
 
690 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  31.85 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  34.78 
 
 
640 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  33.68 
 
 
621 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  28.92 
 
 
401 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  26.09 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  30 
 
 
392 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  32.95 
 
 
695 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  31.2 
 
 
660 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  33.71 
 
 
658 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  34.34 
 
 
690 aa  46.2  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  35.71 
 
 
660 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  34.44 
 
 
381 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  28.16 
 
 
371 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  24.38 
 
 
403 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  24.68 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  24.43 
 
 
583 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>