105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4960 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  100 
 
 
384 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  30.31 
 
 
391 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  32.68 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  30.94 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  29.72 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  41.94 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  37.82 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  31.65 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  31.42 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  30.37 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  28.01 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  27.72 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  27.72 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  27.72 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  44.74 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  33.33 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  28.64 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  29.27 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0034  acyltransferase 3  31.52 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  34.18 
 
 
433 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  36.75 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0023  hypothetical protein  25.36 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0020  hypothetical protein  25.36 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  32 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  28.9 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  30.11 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  28.81 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  24.04 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14310  predicted acyltransferase  26.75 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.335322  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  28.91 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  27.11 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2651  acyltransferase 3  25.34 
 
 
363 aa  60.1  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  31.25 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  34.78 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2879  hypothetical protein  22.09 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  23.96 
 
 
383 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  42.61 
 
 
363 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  32.8 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  32.98 
 
 
448 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  20.71 
 
 
584 aa  56.6  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  30.46 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  28.44 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  37.86 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  27.02 
 
 
366 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  29.01 
 
 
393 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  29.83 
 
 
362 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  32 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  26.55 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  28.74 
 
 
435 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  33.33 
 
 
660 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  30.54 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  32.4 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  25.08 
 
 
368 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  20.05 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  35.14 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  25.77 
 
 
710 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  25.77 
 
 
710 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.22 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  36.45 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  29.19 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  22.96 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  31.93 
 
 
644 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  31.9 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  31.67 
 
 
658 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  20.5 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  25.71 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  31.67 
 
 
658 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  19.56 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  29.87 
 
 
374 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  26.24 
 
 
587 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  27.92 
 
 
372 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2263  acyltransferase 3  25.53 
 
 
425 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0531  acyltransferase 3  29.43 
 
 
342 aa  46.6  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  28.71 
 
 
478 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  38.79 
 
 
330 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  25.22 
 
 
384 aa  46.2  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  22.57 
 
 
660 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  32.21 
 
 
632 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28.35 
 
 
679 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  28.82 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  34.29 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  37.82 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.25 
 
 
695 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  31.71 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  30.7 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  25.87 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  30.91 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  30.46 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0955  acyltransferase 3  26.71 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0973  acyltransferase 3  26.71 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  36.71 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  29.92 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  32.03 
 
 
675 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  31.29 
 
 
759 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  32.53 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25262  predicted protein  23.65 
 
 
1062 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417576  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  27.93 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  29.41 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  24.85 
 
 
371 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  25.16 
 
 
372 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>