20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14310 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14310  predicted acyltransferase  100 
 
 
365 aa  744    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.335322  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  24.29 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  28.46 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  29.87 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  24.78 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  24.39 
 
 
349 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  27.36 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.36 
 
 
660 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  24.35 
 
 
351 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  23.83 
 
 
377 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1392  acyltransferase 3  28.88 
 
 
369 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.3 
 
 
371 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  29.2 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  25.13 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  29.82 
 
 
392 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  25.37 
 
 
644 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.04 
 
 
660 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  24.51 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  28.24 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  28.24 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>