More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0330 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  100 
 
 
397 aa  766    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3031  acyltransferase 3  38.4 
 
 
438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  39.51 
 
 
515 aa  209  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3492  acyltransferase 3  33.42 
 
 
531 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  31 
 
 
387 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  31 
 
 
387 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  32.36 
 
 
396 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  30.73 
 
 
387 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  33.42 
 
 
403 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  34.99 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  34.89 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  35.7 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  35.7 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4285  acyltransferase 3  34.76 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  32.01 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  31.48 
 
 
561 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  29.88 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  30.17 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11280  acyltransferase  30.4 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.795947  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  29.02 
 
 
587 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  32.51 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1295  acyltransferase 3  31.73 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.71 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  29.24 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  27.43 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.75 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  29.71 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.32 
 
 
640 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  26.16 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  25.67 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  27.66 
 
 
645 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0417  acyltransferase 3  32.63 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  25.98 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.53 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.46 
 
 
647 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  33.73 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  27.6 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  28.53 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  30.1 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0643  acyltransferase 3  29.09 
 
 
693 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.29 
 
 
690 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.15 
 
 
681 aa  67  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  27.25 
 
 
671 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0809  acyltransferase 3  28.47 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  27.06 
 
 
688 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  31.52 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  28.18 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  25.13 
 
 
643 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  27.92 
 
 
675 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  22.93 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  27.73 
 
 
632 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.75 
 
 
637 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  27.72 
 
 
364 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  26.55 
 
 
734 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  28.98 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  26.76 
 
 
715 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.37 
 
 
682 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  28.98 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  27.68 
 
 
676 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  23.14 
 
 
349 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  24.35 
 
 
657 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  27.71 
 
 
629 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  26.38 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.13 
 
 
695 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  24.61 
 
 
657 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  25.26 
 
 
622 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  26.3 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  27.22 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  29.01 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  25.74 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  29.77 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  26.77 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  35.85 
 
 
358 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  29.72 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  27.04 
 
 
396 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  27.5 
 
 
716 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  28.61 
 
 
630 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  21.84 
 
 
603 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  21.84 
 
 
603 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  28.96 
 
 
642 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.84 
 
 
616 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  28.94 
 
 
339 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  29.78 
 
 
679 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  30.49 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  27.27 
 
 
684 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0124  acyltransferase 3  29.43 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  28.65 
 
 
711 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  28.74 
 
 
695 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  29.07 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  30.27 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  30.27 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  30.27 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  29.57 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  25.78 
 
 
683 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  32.54 
 
 
644 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  22.87 
 
 
584 aa  57  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  24.75 
 
 
604 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  24.81 
 
 
690 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  26.02 
 
 
695 aa  57  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  24.09 
 
 
393 aa  57  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>