More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2458 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  100 
 
 
424 aa  825    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  60 
 
 
439 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  50.49 
 
 
415 aa  349  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0809  acyltransferase 3  50.12 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  43.81 
 
 
413 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  34.37 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  33.93 
 
 
403 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  31.21 
 
 
435 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  36.59 
 
 
407 aa  139  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  35.21 
 
 
392 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  35.21 
 
 
392 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  36.07 
 
 
394 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  35.21 
 
 
392 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4464  acyltransferase 3  36.79 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  36.34 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  36.34 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0417  acyltransferase 3  37.5 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  36.34 
 
 
387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  32.2 
 
 
587 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  35.61 
 
 
404 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  35.34 
 
 
401 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  34.53 
 
 
396 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  34.53 
 
 
396 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  36.15 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  33.15 
 
 
396 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  30.83 
 
 
561 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  34.17 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11280  acyltransferase  34.38 
 
 
383 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.795947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  33.8 
 
 
376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4285  acyltransferase 3  35.35 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  31.97 
 
 
378 aa  106  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  38.05 
 
 
357 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  27.74 
 
 
515 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  30.48 
 
 
671 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  39.16 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  28.22 
 
 
690 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2361  acyltransferases-like protein  52.08 
 
 
149 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3937  acyltransferase 3  27.97 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  24.94 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  28.36 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  26.23 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  24.94 
 
 
621 aa  67  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  31.13 
 
 
682 aa  66.6  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.4 
 
 
690 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  33.51 
 
 
681 aa  66.6  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25.26 
 
 
695 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  25.43 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  31.16 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  23.83 
 
 
360 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3031  acyltransferase 3  30.47 
 
 
438 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  37.97 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  22.36 
 
 
367 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  29.79 
 
 
635 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  26.35 
 
 
647 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  26.35 
 
 
629 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  27.5 
 
 
641 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.57 
 
 
638 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3648  acyltransferase 3  26.55 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  27.31 
 
 
632 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  32.48 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  30.12 
 
 
683 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  24.94 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.32 
 
 
667 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  31.05 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25.93 
 
 
584 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  21.78 
 
 
603 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  31.56 
 
 
726 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  31.56 
 
 
726 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  32.46 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  31.56 
 
 
726 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  28.9 
 
 
673 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  32.68 
 
 
377 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  32.46 
 
 
401 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  32.46 
 
 
410 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  29.07 
 
 
598 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.63 
 
 
660 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25 
 
 
382 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  31.33 
 
 
642 aa  56.6  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  31.5 
 
 
720 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  30.77 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  35.71 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3554  acyltransferase 3  30.77 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  30.77 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  32.1 
 
 
625 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3975  acyltransferase 3  30.77 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.18 
 
 
629 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.67 
 
 
637 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  31.28 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  21.52 
 
 
603 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  25.19 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  31.68 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  31.12 
 
 
632 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.69 
 
 
616 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  21.52 
 
 
603 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  35.71 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  23.1 
 
 
583 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  35.22 
 
 
621 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  31.61 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.43 
 
 
675 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  29.22 
 
 
378 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.794297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>