194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4078 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  100 
 
 
378 aa  746    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  52.66 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  49.17 
 
 
387 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  48.9 
 
 
387 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  48.9 
 
 
387 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  47.93 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11280  acyltransferase  46.3 
 
 
383 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.795947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  48.34 
 
 
387 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  44.94 
 
 
404 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  44.65 
 
 
396 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  44.65 
 
 
396 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  42.74 
 
 
357 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4285  acyltransferase 3  45.51 
 
 
421 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  37.57 
 
 
403 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  36.79 
 
 
403 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  37.18 
 
 
407 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  37.65 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  35.95 
 
 
392 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  35.95 
 
 
392 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  34.88 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  37.54 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  36.16 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  33.68 
 
 
415 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4464  acyltransferase 3  36.19 
 
 
404 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0417  acyltransferase 3  35.2 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  31.08 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  33.03 
 
 
587 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  31.88 
 
 
435 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  34.88 
 
 
561 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  33.84 
 
 
439 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  33.33 
 
 
424 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0809  acyltransferase 3  31.03 
 
 
434 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2361  acyltransferases-like protein  50.79 
 
 
149 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115726  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  30.15 
 
 
515 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  28.13 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.17 
 
 
656 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  26.46 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  25.17 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  28.87 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  28.25 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  27.06 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  32.05 
 
 
660 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  34.16 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.77 
 
 
616 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  31.55 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  33.11 
 
 
342 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  25.15 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  29.22 
 
 
374 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  24.84 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  27.08 
 
 
679 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  26.17 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3079  acyltransferase 3  28.88 
 
 
716 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3139  acyltransferase 3  28.88 
 
 
716 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3096  acyltransferase 3  28.88 
 
 
716 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140051  normal  0.0654687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3492  acyltransferase 3  28.06 
 
 
531 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.07 
 
 
385 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  24.63 
 
 
696 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  27.78 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  31.48 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  24.93 
 
 
363 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  27.3 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  28.87 
 
 
354 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  26.02 
 
 
377 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  32.58 
 
 
356 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  22.19 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  28.66 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  27.08 
 
 
375 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1295  acyltransferase 3  33.97 
 
 
423 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  28.53 
 
 
630 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  25.65 
 
 
690 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  27.08 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4138  acyltransferase 3  26.44 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4789  acyltransferase 3  26.44 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  28.57 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3378  acyltransferase 3  26.44 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  27.08 
 
 
375 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  27.01 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  30.92 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  27.01 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  27.01 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  34.81 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  28.57 
 
 
718 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  31.25 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  26.01 
 
 
366 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  26.67 
 
 
660 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  34.44 
 
 
385 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.54 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  22 
 
 
386 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  32.5 
 
 
632 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  30.82 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  25.3 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  30.85 
 
 
671 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  26.01 
 
 
422 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  27.45 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  28.27 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  23.12 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1626  acyltransferase family protein  27.08 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  25.64 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  25.64 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1402  acyltransferase family protein  27.08 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>