186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2783 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  100 
 
 
349 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  34.9 
 
 
371 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  28.72 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  31.1 
 
 
419 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  32.46 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  32.44 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  29.17 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  28.9 
 
 
366 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  29.68 
 
 
376 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  27.42 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  30.11 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  29.11 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  27.47 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  26.95 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  26.95 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  26.95 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  27.1 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  26.26 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  26.1 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  34.55 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  26 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  27.97 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  25.32 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  25.84 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  29.74 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25.49 
 
 
382 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  29.81 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  26.91 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  26.25 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  26.69 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  25.12 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  27.04 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  27.86 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  27.19 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  28.24 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  27.4 
 
 
353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  26.53 
 
 
448 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  26.84 
 
 
376 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  31.82 
 
 
404 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  31 
 
 
359 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  31.25 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  26.53 
 
 
362 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.88 
 
 
371 aa  62.8  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  25 
 
 
528 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  27.08 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  26.92 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  24.14 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  27.3 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  26.19 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  28.34 
 
 
371 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  25.14 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  23.7 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0034  acyltransferase 3  24.93 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  26.32 
 
 
478 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  23.2 
 
 
350 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  24.25 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  32.74 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  27.24 
 
 
372 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  27.32 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  24.32 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  27.78 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  28.42 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  25.34 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  26.54 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  27.01 
 
 
368 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  24.93 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  27.38 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  29.83 
 
 
436 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  43.75 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  23.24 
 
 
403 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  31.91 
 
 
366 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  25.48 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4789  acyltransferase 3  25.31 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4138  acyltransferase 3  25.31 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3378  acyltransferase 3  25.31 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  30.13 
 
 
430 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  35.35 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2850  acyltransferase 3  26.67 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114949 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  26.44 
 
 
635 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  27.51 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  29.76 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  23.84 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  34.13 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  26.22 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  29.76 
 
 
389 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  35.05 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.07 
 
 
616 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  26.34 
 
 
397 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0531  acyltransferase 3  36.59 
 
 
342 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  24.79 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  24.02 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  26.33 
 
 
367 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  27.86 
 
 
396 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0023  hypothetical protein  24.14 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  26.53 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  41.3 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  26.91 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  26.44 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  23.1 
 
 
396 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.82 
 
 
639 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>