More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4357 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  100 
 
 
448 aa  864    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  48.63 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  40.69 
 
 
404 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  39.32 
 
 
436 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  40.05 
 
 
404 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  38.85 
 
 
478 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  38.46 
 
 
407 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  38.46 
 
 
407 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  38.46 
 
 
407 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  33.92 
 
 
433 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  34.93 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  30.56 
 
 
371 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  31.18 
 
 
356 aa  106  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  32.16 
 
 
391 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  32.64 
 
 
367 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  30.47 
 
 
365 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  24.88 
 
 
383 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  27.45 
 
 
385 aa  90.5  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  29.97 
 
 
353 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  29.01 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  27.56 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  27.6 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  26.16 
 
 
372 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  30.77 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  28.54 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.34 
 
 
656 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  28.66 
 
 
363 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.09 
 
 
616 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  26.88 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  33.33 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  28.43 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28.19 
 
 
679 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  26.72 
 
 
662 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  21.28 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  27.92 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  27.92 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  25.06 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.31 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  25.79 
 
 
660 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  25 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  30 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  29.04 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  29.32 
 
 
713 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  26 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  29.08 
 
 
641 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  21.46 
 
 
584 aa  66.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  24.93 
 
 
658 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  24.64 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  25.39 
 
 
658 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  29.53 
 
 
665 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  28.68 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  26.61 
 
 
640 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  22.34 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  23.25 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  24.76 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.87 
 
 
638 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  29.19 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  26.09 
 
 
360 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  27.84 
 
 
375 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  26.26 
 
 
397 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  34.33 
 
 
383 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  28.91 
 
 
658 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  33.14 
 
 
413 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  27.46 
 
 
375 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  27.41 
 
 
362 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.07 
 
 
656 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.01 
 
 
690 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  22.96 
 
 
603 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  22.96 
 
 
603 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  27.58 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  29.77 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  29.77 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  23.3 
 
 
673 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  24.51 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  28.65 
 
 
652 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  24.51 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  29.16 
 
 
387 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  25.51 
 
 
361 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  23.45 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0124  acyltransferase 3  31.55 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  27.88 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  23.48 
 
 
379 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  30 
 
 
614 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  23.45 
 
 
369 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  23.46 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  26.25 
 
 
683 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.63 
 
 
681 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  25.06 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  32.43 
 
 
383 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  26.2 
 
 
378 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  32.98 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.51 
 
 
695 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  28.57 
 
 
408 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1626  acyltransferase family protein  27.84 
 
 
376 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  25.38 
 
 
643 aa  60.1  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3186  acyltransferase family protein  27.84 
 
 
376 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1402  acyltransferase family protein  27.84 
 
 
375 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  32.98 
 
 
356 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  26.42 
 
 
629 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2128  acyltransferase family protein  27.84 
 
 
375 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>