44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6303 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  100 
 
 
389 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  32.27 
 
 
358 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  33.14 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  29.77 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  29.57 
 
 
358 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0243  acyltransferase family protein  31.61 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473952  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  27.56 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  26.88 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4978  acyltransferase 3  27.59 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  24.44 
 
 
352 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  29.49 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  25.37 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0841  O-acetyltransferase  31.58 
 
 
357 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  33.12 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  24.18 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  32.95 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  31.82 
 
 
339 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  30.06 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  33.57 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  29.88 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  30.25 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  25.8 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0816  O-acetyltransferase  28.99 
 
 
357 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  30.12 
 
 
356 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  24.47 
 
 
353 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  24.84 
 
 
353 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  29.19 
 
 
392 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
348 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  30.92 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  31.54 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  32.3 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  24.34 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  30.91 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  29.14 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  28 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  31.54 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  29.14 
 
 
354 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  26.44 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  24.53 
 
 
360 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  30.07 
 
 
365 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  21.63 
 
 
374 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
714 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  26.95 
 
 
398 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.63 
 
 
660 aa  42.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>