63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2240 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  100 
 
 		 373 aa  744    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  25.84 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  26.69 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  30.83 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  27.3 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  20.94 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  27.93 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  31.09 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  27.78 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  25.33 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  27.81 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  26.45 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  27.58 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  26.45 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  25 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  26.97 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3554  acyltransferase 3  26.3 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3975  acyltransferase 3  26.3 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  26.3 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  24.88 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  26.07 
 
 		 352 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  31.58 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  27.08 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  26.92 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  29.14 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  31.12 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  27.42 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0816  O-acetyltransferase  35.48 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  27.11 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  27.81 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  26.5 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0841  O-acetyltransferase  35.19 
 
 		 357 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  29.94 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  35 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  35 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  26.29 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  33.33 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  31.58 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  26.59 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  33.77 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  26.97 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0719  acyltransferase-like protein  28.33 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.838666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  28.49 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  29.91 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1295  acyltransferase 3  26.59 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  29.91 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  29.63 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  29.91 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  29.91 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1392  acyltransferase 3  26.11 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  34.74 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  27.3 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  25.98 
 
 		 665 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.03 
 
 		 643 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  39.02 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  37 
 
 		 604 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0243  acyltransferase family protein  28.08 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4209  acyltransferase  26.09 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  35.37 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  28.22 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  28.65 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>