43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0243 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0243  acyltransferase family protein  100 
 
 		 383 aa  744    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  31.27 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  26.61 
 
 		 358 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  31.85 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  33.22 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4978  acyltransferase 3  26.83 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  26.26 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  29.79 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  28.69 
 
 		 695 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  27.36 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  32.99 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  31.28 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  31.28 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  31.28 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  31.46 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  29.47 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  27.65 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  32.4 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  26.74 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  31.03 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  31.64 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  29.81 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  29.19 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  30.57 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  29.35 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  24.31 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  31.64 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  34.18 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.88 
 
 		 679 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  27.75 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.08 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  30.67 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  26.11 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  29.65 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  32.29 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0841  O-acetyltransferase  28.12 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  30.46 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  36.15 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.28 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  28.48 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  30.05 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>