101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2004 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  100 
 
 
416 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  42.58 
 
 
378 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  41.56 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  46.55 
 
 
478 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  32.87 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  30.16 
 
 
412 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  30.16 
 
 
412 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  30.16 
 
 
412 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  31.32 
 
 
380 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  30.46 
 
 
412 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  30.13 
 
 
412 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  30.13 
 
 
412 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  29.89 
 
 
412 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  29.89 
 
 
412 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  36.49 
 
 
387 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  30.3 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  36.34 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  34.38 
 
 
373 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  31.95 
 
 
350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  30.25 
 
 
369 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
714 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  28.46 
 
 
389 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  31.64 
 
 
363 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  31.1 
 
 
371 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  29.28 
 
 
369 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  29.61 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  31.22 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  35.74 
 
 
358 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  28.7 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  27.35 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  32.39 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  29.94 
 
 
339 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  30.46 
 
 
371 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  28 
 
 
336 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  26.98 
 
 
358 aa  87.8  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  30.63 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  28.18 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  29.89 
 
 
351 aa  87  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  31.74 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  32.52 
 
 
360 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  27.3 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  28.08 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  26.4 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  27.2 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  26.68 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  28.93 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  29.93 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  26.05 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  30.65 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  32.07 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  28.1 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  34.18 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  28.12 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  34.18 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  30.17 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  27.42 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  28.62 
 
 
318 aa  63.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  29.13 
 
 
367 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  27.08 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  25.42 
 
 
349 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  30.47 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  29.2 
 
 
415 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  29.89 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  26.65 
 
 
710 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  26.65 
 
 
710 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  29.77 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  29.6 
 
 
365 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  26.17 
 
 
309 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  31.1 
 
 
377 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  24.93 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  30.77 
 
 
627 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1542  acyltransferase 3  36.17 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244939  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  44.83 
 
 
671 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  33.33 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.23 
 
 
638 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  41.86 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  26.06 
 
 
658 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0220  hypothetical protein  32.58 
 
 
201 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152958  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  23.43 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  29.18 
 
 
742 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  36.05 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.68 
 
 
658 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  30.06 
 
 
402 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  30.63 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  24.93 
 
 
660 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  33.73 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  39.6 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  23.77 
 
 
604 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  37.21 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  41.38 
 
 
680 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  32.82 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  26.14 
 
 
690 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  34.69 
 
 
713 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  25.44 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  32.67 
 
 
402 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  31.22 
 
 
395 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  33.33 
 
 
344 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.14 
 
 
660 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  24.4 
 
 
657 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  28.68 
 
 
382 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>