35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4978 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4978  acyltransferase 3  100 
 
 
400 aa  797    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  36.41 
 
 
390 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  25.79 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  27.06 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  30.69 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  28.63 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  28.84 
 
 
391 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  27.44 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  26.89 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  26.69 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  28.88 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  26.77 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  28.14 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  28.15 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  29.76 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  26.77 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  26.96 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3554  acyltransferase 3  25.95 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  29.67 
 
 
362 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3975  acyltransferase 3  25.95 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  25.95 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  23.48 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  30.27 
 
 
360 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  28.74 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  28.09 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0243  acyltransferase family protein  27.08 
 
 
383 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473952  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  26.36 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  27.91 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  24.77 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  23.7 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  23.46 
 
 
369 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  25.73 
 
 
352 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0841  O-acetyltransferase  27.75 
 
 
357 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  25.21 
 
 
695 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28 
 
 
679 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>