268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3365 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  91.82 
 
 
391 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  98.72 
 
 
391 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  91.56 
 
 
391 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  90.77 
 
 
391 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  100 
 
 
391 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3554  acyltransferase 3  91.56 
 
 
391 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3975  acyltransferase 3  91.56 
 
 
391 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  77.25 
 
 
410 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  76.23 
 
 
390 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  77.25 
 
 
401 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  77.3 
 
 
410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  72.18 
 
 
403 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  70.8 
 
 
403 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  67.29 
 
 
396 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1875  putative acyltransferase  73.87 
 
 
133 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1667  acyltransferase 3  73.87 
 
 
133 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.941951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  27.14 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4978  acyltransferase 3  28.84 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  28.85 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  27.63 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  30.06 
 
 
684 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.33 
 
 
637 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  28.45 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  28.57 
 
 
682 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  26.56 
 
 
690 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  25.64 
 
 
362 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  25 
 
 
352 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  28.12 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  23.75 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  26.75 
 
 
681 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  27.12 
 
 
641 aa  63.5  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4138  acyltransferase 3  30 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4789  acyltransferase 3  30 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  29.74 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3378  acyltransferase 3  30 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2850  acyltransferase 3  31.36 
 
 
379 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114949 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1721  acyltransferase  26.82 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1392  acyltransferase 3  25.32 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  24.92 
 
 
660 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1744  acyltransferase  26.54 
 
 
394 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0787383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  29.46 
 
 
675 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1900  hypothetical protein  26.54 
 
 
394 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  27.43 
 
 
634 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  30.99 
 
 
397 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  25.96 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  27.76 
 
 
716 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  25.28 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  25.28 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  37.12 
 
 
760 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  30.28 
 
 
679 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3043  acyltransferase 3  27.62 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  29.23 
 
 
695 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  26.55 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  27.81 
 
 
662 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0715  hypothetical protein  28.02 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  28.33 
 
 
660 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  25 
 
 
356 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  27.5 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  36.2 
 
 
360 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  28.45 
 
 
718 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.51 
 
 
359 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  26.92 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  26.15 
 
 
344 aa  57  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  26.65 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.9 
 
 
616 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  29.37 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  29.58 
 
 
632 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  30.85 
 
 
392 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  32.37 
 
 
635 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  28.79 
 
 
390 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  26.35 
 
 
777 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  25.4 
 
 
657 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  28.68 
 
 
358 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  29.31 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  25.96 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  28.26 
 
 
621 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  30.48 
 
 
621 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.9 
 
 
667 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  24.87 
 
 
657 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  27.88 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1402  acyltransferase family protein  25.28 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  26.88 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  24.37 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2128  acyltransferase family protein  25.28 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  27.97 
 
 
759 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1626  acyltransferase family protein  25.28 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  26.44 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  32.7 
 
 
630 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  29.56 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0719  acyltransferase-like protein  26 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.838666  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3186  acyltransferase family protein  25.28 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  28.01 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  32.61 
 
 
720 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5677  acyltransferase 3  28 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679825  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  30.06 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  28.29 
 
 
598 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.99 
 
 
638 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  27.48 
 
 
679 aa  53.5  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  28.65 
 
 
340 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  29.45 
 
 
583 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>