More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5677 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5677  acyltransferase 3  100 
 
 
384 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679825  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72040  putative acyltransferase  63.12 
 
 
380 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6254  acyltransferase 3  49.31 
 
 
385 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0715  hypothetical protein  39.44 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1744  acyltransferase  39.95 
 
 
394 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0787383  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1900  hypothetical protein  39.95 
 
 
394 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1721  acyltransferase  39.69 
 
 
394 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653575  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.98 
 
 
660 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  28.68 
 
 
641 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  27.87 
 
 
603 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  27.87 
 
 
603 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  26.51 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  31.31 
 
 
716 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.03 
 
 
682 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  30.63 
 
 
671 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  30.21 
 
 
629 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.95 
 
 
647 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  26.25 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  30.13 
 
 
690 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  25.89 
 
 
604 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  25.89 
 
 
604 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  27.74 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  28.69 
 
 
640 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  26 
 
 
621 aa  76.6  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  27.93 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.37 
 
 
660 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  27.08 
 
 
658 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  28.31 
 
 
681 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  30.54 
 
 
635 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  31.22 
 
 
656 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  25.07 
 
 
646 aa  72.8  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  30.37 
 
 
675 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  27.36 
 
 
742 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  27.44 
 
 
645 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  34.07 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  27.89 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  25.63 
 
 
604 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.24 
 
 
584 aa  69.7  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.68 
 
 
690 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  32.42 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  31.55 
 
 
676 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.92 
 
 
679 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  23.65 
 
 
602 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  32.42 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  34.72 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  30.38 
 
 
715 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  25.53 
 
 
660 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.55 
 
 
629 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.35 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  28.19 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  38.42 
 
 
635 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.91 
 
 
658 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  25.2 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  27.62 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  32.76 
 
 
734 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.61 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  30.8 
 
 
695 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.19 
 
 
665 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  26.46 
 
 
675 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  28.08 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  29.17 
 
 
629 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  26.57 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  30.86 
 
 
364 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  26.57 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  31.74 
 
 
720 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  34.66 
 
 
977 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  27.01 
 
 
605 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.91 
 
 
656 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  28.72 
 
 
673 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.56 
 
 
675 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  28.98 
 
 
710 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  33.7 
 
 
711 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  26.77 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  28.98 
 
 
710 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  27.64 
 
 
684 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  29.6 
 
 
630 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  26.37 
 
 
615 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  32.78 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  34.08 
 
 
685 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  27.49 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  24.06 
 
 
386 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  31.86 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  26.88 
 
 
598 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  27.54 
 
 
396 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  30.47 
 
 
339 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  28.61 
 
 
368 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  33.73 
 
 
374 aa  62.8  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  27.88 
 
 
716 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  27.3 
 
 
627 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  29.78 
 
 
720 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.87 
 
 
634 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  26.38 
 
 
695 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  32.82 
 
 
642 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.72 
 
 
616 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  28.42 
 
 
665 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  23.1 
 
 
621 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  27.27 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.74 
 
 
638 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  30.77 
 
 
696 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  28.53 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>