113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0996 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  33.18 
 
 
354 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  32.54 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  33.82 
 
 
354 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  31.53 
 
 
362 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  31.44 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  32.57 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  31.9 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  34.15 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  34.63 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  33.1 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  35.92 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.14 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  28.38 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  32.74 
 
 
356 aa  62.4  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  29.13 
 
 
364 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  28.81 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  30.13 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  27.21 
 
 
383 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  31.67 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  27.55 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  24.93 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  34.62 
 
 
382 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  35.93 
 
 
372 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  28 
 
 
360 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  24.79 
 
 
395 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  24.79 
 
 
395 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  26.03 
 
 
384 aa  56.6  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  27.27 
 
 
354 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.19 
 
 
353 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  27.4 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  29.25 
 
 
379 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.66 
 
 
377 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  28.97 
 
 
354 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  29.07 
 
 
393 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  23.82 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  30.99 
 
 
587 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  32.14 
 
 
399 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  27.9 
 
 
410 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  37.21 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  28.17 
 
 
383 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  34.94 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  33.54 
 
 
403 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  32.97 
 
 
419 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  27.88 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  30.41 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  24.44 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  38.14 
 
 
413 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  25.83 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  32.74 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  30.41 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  41.98 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  44.74 
 
 
395 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  28.85 
 
 
368 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  25.58 
 
 
437 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  25 
 
 
391 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  27.1 
 
 
382 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  32.28 
 
 
384 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  33.12 
 
 
564 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  30.26 
 
 
508 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  27.95 
 
 
367 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  27.75 
 
 
364 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  31.65 
 
 
342 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  29.51 
 
 
387 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  30.46 
 
 
353 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  27.98 
 
 
359 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  26.85 
 
 
354 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  25.99 
 
 
340 aa  45.8  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  29.73 
 
 
397 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  27.38 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  29.03 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  25.66 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  36.96 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  32.89 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  25.48 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  25.66 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  30.71 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1185  acyltransferase 3  22.88 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  26.75 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  29.41 
 
 
380 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  33.73 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  33.33 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  30.43 
 
 
406 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  26.32 
 
 
389 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  28.95 
 
 
394 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  24.57 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  39.02 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  26.38 
 
 
410 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  24.12 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  26.38 
 
 
401 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  25.71 
 
 
375 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  32.19 
 
 
409 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  30.97 
 
 
364 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  33.33 
 
 
360 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  45.28 
 
 
412 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  45.28 
 
 
412 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  25.08 
 
 
391 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  45.28 
 
 
412 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  45.28 
 
 
412 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  45.28 
 
 
412 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>