52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2427 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  100 
 
 
358 aa  714    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  47.35 
 
 
366 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  28.25 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0243  acyltransferase family protein  32.73 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473952  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  29.48 
 
 
389 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  29.35 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  29.66 
 
 
403 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  30.43 
 
 
403 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  31.08 
 
 
410 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4978  acyltransferase 3  28.88 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  25.2 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  29.76 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  29.73 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  24.65 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  29.73 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  29.73 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  28.28 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  23.38 
 
 
394 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  28.69 
 
 
378 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  23.05 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  23.81 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  28.21 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  27.61 
 
 
621 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  27.56 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  25.71 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  23.96 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  24.47 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  25.44 
 
 
396 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  29.38 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  28.21 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  26.27 
 
 
398 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  26.36 
 
 
604 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  27.54 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  25.82 
 
 
373 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3554  acyltransferase 3  27.56 
 
 
391 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3975  acyltransferase 3  27.56 
 
 
391 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  27.56 
 
 
391 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  36.26 
 
 
383 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  25.85 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  27.69 
 
 
422 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  24.53 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  35.16 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  25 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  26.82 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  26.11 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  34.07 
 
 
383 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  26.76 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  28.78 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  26.63 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  26.48 
 
 
369 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0841  O-acetyltransferase  27.75 
 
 
357 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.14 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>