62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4209 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007490  RSP_4209  acyltransferase  100 
 
 
392 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3594  hypothetical protein  84.02 
 
 
390 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.602516 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3457  acyltransferase 3  71.35 
 
 
384 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0914284  normal  0.537431 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3723  hypothetical protein  71.35 
 
 
384 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2593  hypothetical protein  28.01 
 
 
409 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110945  normal  0.12741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4628  hypothetical protein  32.89 
 
 
401 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  hitchhiker  0.00905511 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2382  acyltransferase family protein  29.46 
 
 
405 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  30.77 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0626  acyltransferase  28.68 
 
 
405 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2521  acyltransferase family protein  29.88 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1572  acyltransferase 3  30.11 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.653564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1867  acyltransferase-like protein  28.53 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0282967  hitchhiker  0.0000000000000352917 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01696  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08520)  24.62 
 
 
547 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0457343  normal  0.0488755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0119  hypothetical protein  23.31 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0158514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  24.86 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  19.71 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  35.61 
 
 
233 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  24.05 
 
 
369 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4669  acyltransferase 3  29.19 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53122  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1009  acyltransferase 3  38.1 
 
 
473 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0379524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  19.71 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  19.71 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  27.15 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  27.23 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  37.63 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  36.56 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  26.82 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0104  hypothetical protein  23.6 
 
 
365 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.402195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  19.71 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  37.08 
 
 
376 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  23.37 
 
 
378 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  26.75 
 
 
377 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  27.62 
 
 
404 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  26.88 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  38.82 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  37.23 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  23.44 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  25.97 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  39.19 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  26.54 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  41.56 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  27.83 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  30 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  38.89 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  27.83 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  27.86 
 
 
528 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11061  conserved hypothetical protein  22.65 
 
 
476 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.101379  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  27.83 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  30.09 
 
 
357 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  34.69 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
714 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  30.58 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  38.71 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1645  acyltransferase family protein  21.19 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.310248  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  26.89 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3700  acyltransferase family protein  21.65 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0274715  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  35.05 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.09 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  25.22 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  28.21 
 
 
382 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  25.22 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  33.33 
 
 
370 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>