102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1540 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  100 
 
 		 404 aa  806    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2190  acyltransferase 3  27.55 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  26.13 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  26.13 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  26.13 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  25.88 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  24.35 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  27.2 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  23.63 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1645  acyltransferase family protein  26.09 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3700  acyltransferase family protein  26.09 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0274715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  23.63 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  23.13 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  26.05 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  24.21 
 
 		 710 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  24.21 
 
 		 710 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  24.38 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  27.69 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  25.54 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  29.79 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4628  hypothetical protein  23.62 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  hitchhiker  0.00905511 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  24.35 
 
 		 604 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  25.95 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  27.24 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2521  acyltransferase family protein  24.12 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2382  acyltransferase family protein  24.68 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2593  hypothetical protein  24.74 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110945  normal  0.12741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0626  acyltransferase  25.82 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  26.2 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  23.67 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  25.65 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1009  acyltransferase 3  27.73 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0379524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  22.6 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0479  acyltransferase 3  23.28 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.907036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  25.76 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  24.71 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  24.76 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  24.76 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  23.77 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  30.07 
 
 		 691 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  25.85 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  27.97 
 
 		 673 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  36.07 
 
 		 336 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  24.55 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  26.25 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  23.83 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  24.48 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  24.37 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0715  hypothetical protein  24.26 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  25.12 
 
 		 682 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  24.61 
 
 		 377 aa  47  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  24.62 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0119  hypothetical protein  22.88 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0158514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  24.93 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  25.26 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  26.9 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3871  acyltransferase 3  29.45 
 
 		 372 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.833445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  24.17 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  24.35 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  23.66 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  23.14 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.27 
 
 		 681 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  25.56 
 
 		 602 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4209  acyltransferase  26.25 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  24.56 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  23.22 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3369  acyltransferase 3  30.46 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  24.56 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  25.37 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1462  acyltransferase 3  27.18 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  23.68 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  23.1 
 
 		 603 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  23.1 
 
 		 603 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  24.88 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  32.1 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.38 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  25.19 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  22.39 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  31.21 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  28.28 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  24.85 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  31 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  24.62 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3866  acyltransferase 3  25.7 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  22.73 
 
 		 350 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  23.96 
 
 		 657 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  23.35 
 
 		 657 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 714 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  22.19 
 
 		 622 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  26.65 
 
 		 336 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  26.38 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  32.56 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  23.41 
 
 		 587 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1867  acyltransferase-like protein  24.87 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0282967  hitchhiker  0.0000000000000352917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  25.62 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  23.24 
 
 		 635 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  23.06 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6254  acyltransferase 3  28.21 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  25 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>