49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1462 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1462  acyltransferase 3  100 
 
 
401 aa  768    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  32.9 
 
 
408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  32.02 
 
 
397 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0479  acyltransferase 3  33.15 
 
 
405 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.907036  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  36.28 
 
 
408 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  37.09 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  37.25 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  34.76 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  36.52 
 
 
357 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  28.61 
 
 
356 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  30.43 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25.52 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  27.2 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  27.92 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  24.69 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  22.59 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0727  acyltransferase-like protein  28.76 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  23.43 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.72 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  23.43 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  23.43 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  27.03 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  23.43 
 
 
397 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  28.76 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  27.78 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  27.78 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  26.61 
 
 
383 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  24.74 
 
 
378 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  26.8 
 
 
344 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  28.8 
 
 
684 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  26.3 
 
 
344 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  25.44 
 
 
404 aa  46.6  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  26.84 
 
 
587 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.77 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  26.52 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  23 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  25.36 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  26.23 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4628  hypothetical protein  27.41 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  hitchhiker  0.00905511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  25.41 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  27.07 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  26.9 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.61 
 
 
638 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.24 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  20.84 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  26.77 
 
 
691 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  27.46 
 
 
354 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  27.32 
 
 
336 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  26.95 
 
 
333 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>