119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0479 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0479  acyltransferase 3  100 
 
 
405 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.907036  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  37.88 
 
 
397 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  36.59 
 
 
408 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1462  acyltransferase 3  32.88 
 
 
401 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  35.06 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  32.43 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  35.93 
 
 
408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  36.14 
 
 
381 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  36.75 
 
 
357 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  27.22 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  27.38 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  26.8 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  21.92 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  21.92 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  26.23 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  24.62 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  21.29 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  26.7 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  26.7 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  28.09 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  24.69 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  26.34 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  24.68 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  23.66 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  22.17 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  26.85 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  30.09 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  23.32 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  25.51 
 
 
379 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  26.74 
 
 
368 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  23.53 
 
 
385 aa  56.2  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  27.27 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  31.65 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  27.59 
 
 
340 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  28.01 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.3 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  26.39 
 
 
375 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  26.09 
 
 
515 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  26.2 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  32.08 
 
 
564 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  26.42 
 
 
383 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  27.76 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  28.71 
 
 
344 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  31.58 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  27.27 
 
 
340 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  27.05 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  25 
 
 
364 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  30.81 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  23.11 
 
 
435 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  24.92 
 
 
362 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  22.93 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  23.25 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  24.53 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  26.3 
 
 
684 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  21.17 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  22.22 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  24.66 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  22.25 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  28.32 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  26.12 
 
 
346 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  25 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  25.66 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  29.01 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  25.94 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  24.2 
 
 
587 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  24.48 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  26.23 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
714 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  27.74 
 
 
437 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  27.27 
 
 
344 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  24.34 
 
 
309 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  23.31 
 
 
369 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  23.79 
 
 
366 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  25.64 
 
 
346 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  24.63 
 
 
387 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  27.47 
 
 
339 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  25.16 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  26.61 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  27.22 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  26.65 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  27.22 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  26.13 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  26.34 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  22.65 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  27.59 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  27.27 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  26.82 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  25.08 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  25.24 
 
 
528 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  32.08 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  30.86 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  32.08 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3700  acyltransferase family protein  21.34 
 
 
397 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0274715  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  32.75 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  27.09 
 
 
657 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  29.41 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  27.24 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  29.54 
 
 
681 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  26.02 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  21.9 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>