140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2746 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  100 
 
 		 408 aa  818    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  38.32 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0479  acyltransferase 3  36.57 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.907036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1462  acyltransferase 3  33.7 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  29.78 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  30.16 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  30.16 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  30.16 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  30.3 
 
 		 408 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  27.93 
 
 		 587 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  30.56 
 
 		 561 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  27.25 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  26.26 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  23.58 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  24.09 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  27.2 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  25.4 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  23.8 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  26.71 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  28.1 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  27.18 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  26.29 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  28.14 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.2 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  23.91 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  25.2 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  25.13 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  28.71 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  27.06 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  25.82 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2850  acyltransferase 3  27.13 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  25.75 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  32.09 
 
 		 339 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  25.97 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  26.15 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  28.08 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  30.94 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  26.75 
 
 		 695 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  31.53 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  26.58 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  26.7 
 
 		 362 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  29.09 
 
 		 691 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  26.75 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  29.28 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  24.78 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  26.49 
 
 		 378 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  26.28 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  27.4 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  28.95 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  28.71 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.47 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  26.58 
 
 		 339 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  27.4 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4789  acyltransferase 3  29.51 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3378  acyltransferase 3  29.51 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4138  acyltransferase 3  29.51 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  21.31 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  30.46 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  21.31 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  27.4 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  33.03 
 
 		 734 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  25.59 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  21.31 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  25.19 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  23.26 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  25.27 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  24.49 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  26.65 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  29.29 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  25.88 
 
 		 360 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  23.63 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  25.2 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  26.33 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  25.2 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  27.11 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  25.8 
 
 		 356 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  20.57 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.1 
 
 		 638 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  25.47 
 
 		 327 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  26.12 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  23.72 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  24.66 
 
 		 351 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  25.9 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  26.74 
 
 		 321 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.17 
 
 		 656 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  23.39 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  23.17 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  35.24 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  23.74 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  30.11 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  25.15 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  23.22 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  25 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  24.69 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0730198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>