179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4702 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  100 
 
 		 336 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  28.15 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  28.15 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  28.15 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  27.74 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  27.99 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  28.14 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  28.05 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  27.19 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  27.2 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.1 
 
 		 616 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.89 
 
 		 638 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  27.3 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  27.39 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  26.72 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  25.83 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  25.83 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  26.61 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  26.17 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  26.75 
 
 		 645 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  23.28 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  26.89 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0479  acyltransferase 3  26.77 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.907036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25.62 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  30.2 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  25.97 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  24.44 
 
 		 397 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.33 
 
 		 660 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.41 
 
 		 656 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  23.61 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  31.25 
 
 		 642 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  27.6 
 
 		 642 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  26.85 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  31.13 
 
 		 665 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.67 
 
 		 629 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  30.06 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  22.77 
 
 		 363 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  34.64 
 
 		 690 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  25.21 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.53 
 
 		 639 aa  53.1  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  26.43 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  26.62 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  29.17 
 
 		 647 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  30.5 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 584 aa  52.4  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  28.9 
 
 		 630 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  28.73 
 
 		 658 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  24.21 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  31.67 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  33.08 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  30.27 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  27.44 
 
 		 662 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  23.96 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  28.68 
 
 		 658 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  26.57 
 
 		 647 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  25.8 
 
 		 695 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  25.52 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  30.88 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  28 
 
 		 688 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  26.2 
 
 		 626 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  24.85 
 
 		 629 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  27.78 
 
 		 667 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  22.42 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  23.65 
 
 		 598 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  29.33 
 
 		 607 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.22 
 
 		 662 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  28.89 
 
 		 396 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  28.34 
 
 		 684 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  32.43 
 
 		 759 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  23.9 
 
 		 657 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  27.16 
 
 		 720 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  25.59 
 
 		 398 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  32.9 
 
 		 691 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  24.7 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  24.65 
 
 		 690 aa  49.3  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  26.14 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  27.59 
 
 		 665 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  29.03 
 
 		 662 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  25.29 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2850  acyltransferase 3  32.05 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  25.83 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  25.6 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  25.67 
 
 		 410 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  28.69 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  27.57 
 
 		 682 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  31.01 
 
 		 658 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  25.17 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  34.88 
 
 		 656 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  31.75 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.62 
 
 		 637 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  25.67 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.74 
 
 		 603 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.74 
 
 		 603 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 777 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  23.83 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  26.06 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  25.98 
 
 		 695 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  24.85 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>