228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1890 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  100 
 
 
344 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  88.92 
 
 
344 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  88.95 
 
 
344 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  88.95 
 
 
383 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  67.06 
 
 
340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  65.29 
 
 
340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  60.42 
 
 
333 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  48.36 
 
 
340 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  31.67 
 
 
309 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  38.95 
 
 
355 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  36.93 
 
 
337 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  35.24 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  32.77 
 
 
356 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  33.64 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  32.71 
 
 
339 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  32.33 
 
 
367 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  33.44 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  33.33 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  29.78 
 
 
353 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  33.43 
 
 
356 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  32.64 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  35.74 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  33.82 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  32.06 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  31.82 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  37.25 
 
 
354 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  31.04 
 
 
346 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  33 
 
 
354 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  34.64 
 
 
375 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  29.87 
 
 
360 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  34.1 
 
 
364 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  34.5 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  34.52 
 
 
395 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  34.52 
 
 
395 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  31.79 
 
 
357 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  33.78 
 
 
384 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  33.06 
 
 
378 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  32.4 
 
 
348 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  32.52 
 
 
363 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  33.1 
 
 
391 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  32.54 
 
 
382 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  29.36 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  30.11 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  32.56 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  29.27 
 
 
377 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  31.38 
 
 
366 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  30.24 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  31.53 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  26.94 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  33.73 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  30.79 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  33.33 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.53 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.24 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  35.88 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  32.42 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  35.85 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  29 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  30.98 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  29.51 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.68 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28.48 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  26.96 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  25.36 
 
 
397 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  32.11 
 
 
415 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  36.2 
 
 
403 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  29.13 
 
 
404 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  29.67 
 
 
380 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  26.27 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  35.37 
 
 
415 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  28.98 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  26.18 
 
 
385 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  26.92 
 
 
437 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  26.78 
 
 
408 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  23.31 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  27.52 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  28.57 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  32.93 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  27.8 
 
 
364 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.21 
 
 
584 aa  57  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  31.06 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  27.48 
 
 
377 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  25.85 
 
 
357 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  28.38 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  25.85 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  26.44 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  25.85 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  40 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  27.13 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  29.71 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  28.39 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  25.6 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  30.84 
 
 
638 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  29.55 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  28.66 
 
 
430 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  28.39 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  24.23 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  28.7 
 
 
398 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  29.28 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  23.96 
 
 
366 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>