91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1871 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  100 
 
 
397 aa  796    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0479  acyltransferase 3  37.88 
 
 
405 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.907036  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  38.32 
 
 
408 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1462  acyltransferase 3  32.02 
 
 
401 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  30.84 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  30.26 
 
 
408 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  29.51 
 
 
357 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  29.51 
 
 
408 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  29.51 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  28.14 
 
 
336 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  26.29 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  26.7 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  24.93 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  25.49 
 
 
340 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  26.01 
 
 
642 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  28 
 
 
734 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  26.02 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  28.57 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  24.35 
 
 
344 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  27.52 
 
 
583 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  24.35 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  24.43 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  25.19 
 
 
625 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  28.39 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  29.9 
 
 
587 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  27.3 
 
 
657 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  29.17 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  24.36 
 
 
362 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  35.34 
 
 
561 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  25.93 
 
 
340 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.22 
 
 
657 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  30.46 
 
 
359 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  25.2 
 
 
398 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  24.42 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  24.42 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  31.47 
 
 
384 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  26.4 
 
 
658 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  23.2 
 
 
373 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  27.92 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  26.23 
 
 
643 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  26.27 
 
 
695 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  25.75 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  26.37 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.08 
 
 
656 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  22.54 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  25.12 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  30.91 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  26.64 
 
 
685 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  25.69 
 
 
393 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  27.39 
 
 
406 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  25.74 
 
 
710 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  25.74 
 
 
710 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  28.7 
 
 
691 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  24.32 
 
 
366 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.2 
 
 
658 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  24.16 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  23.12 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  22.31 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  22.98 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  26.73 
 
 
632 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  25.6 
 
 
658 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  24.21 
 
 
584 aa  44.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  25 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  24.21 
 
 
675 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.76 
 
 
639 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  23.2 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1867  acyltransferase-like protein  23.51 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0282967  hitchhiker  0.0000000000000352917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  30.23 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  28.02 
 
 
353 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  30.58 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  24.74 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  24.32 
 
 
347 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  24.74 
 
 
684 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  24.44 
 
 
394 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  27.98 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  23.13 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  24.39 
 
 
603 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  26.37 
 
 
715 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  30.65 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  29.83 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  30.97 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  21.69 
 
 
616 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  27.81 
 
 
374 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  22.54 
 
 
371 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  23.68 
 
 
396 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  26.64 
 
 
652 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0124  acyltransferase 3  26.29 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  26.21 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  22.31 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  25.45 
 
 
358 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  27.04 
 
 
647 aa  43.1  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>