144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5194 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  100 
 
 
336 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  33.14 
 
 
350 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  32.01 
 
 
380 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  29.34 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  28.61 
 
 
371 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  33.03 
 
 
351 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  29.94 
 
 
377 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  29.81 
 
 
386 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  30.95 
 
 
467 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  29.57 
 
 
358 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  31.45 
 
 
373 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  29.38 
 
 
321 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  29.43 
 
 
399 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  30.3 
 
 
363 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  29.17 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  30.33 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  28.12 
 
 
358 aa  95.9  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  33.43 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  31.65 
 
 
378 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  28.42 
 
 
416 aa  89.7  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  29.38 
 
 
374 aa  89.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  29.73 
 
 
376 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  29.66 
 
 
412 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  29.66 
 
 
412 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  29.66 
 
 
412 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  29.66 
 
 
412 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
714 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  29.66 
 
 
412 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  29.66 
 
 
412 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  29.66 
 
 
412 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  30.42 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  26.99 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  31.25 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  28.86 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  27.75 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  28.12 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  27.01 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  31.02 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  30.69 
 
 
365 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  27.43 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  28.66 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  26.59 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  29.67 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  28.66 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  29.82 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  29.46 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  26.99 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  26.07 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  26.96 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  34.55 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  25.41 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  26 
 
 
411 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  27.2 
 
 
378 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  28.22 
 
 
647 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  27.95 
 
 
629 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  27.01 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  32.34 
 
 
389 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  33.71 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  24.59 
 
 
379 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  30 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  28.91 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  31.76 
 
 
478 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  23.32 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  26.63 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  27.88 
 
 
437 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  29.34 
 
 
378 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  27.03 
 
 
691 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  24.8 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  23.86 
 
 
369 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  29.08 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  33.33 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  25.07 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1392  acyltransferase 3  25.94 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  23.93 
 
 
359 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  25 
 
 
637 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  26.78 
 
 
424 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  26.7 
 
 
366 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  28.98 
 
 
369 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  25.47 
 
 
436 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  26.43 
 
 
415 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  26.62 
 
 
397 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.27 
 
 
681 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  29.94 
 
 
352 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  27.59 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  27.95 
 
 
629 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  28.88 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  36.07 
 
 
404 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  22.51 
 
 
362 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  29.78 
 
 
381 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6619  acyltransferase 3  26.95 
 
 
345 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  26.58 
 
 
382 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  30.95 
 
 
402 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  29.81 
 
 
401 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  24.64 
 
 
363 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  28.42 
 
 
382 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  22.34 
 
 
397 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  22.34 
 
 
397 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  21.57 
 
 
584 aa  46.2  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  24.59 
 
 
658 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  25.61 
 
 
368 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>