161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3191 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  100 
 
 
378 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  33.87 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  36.93 
 
 
414 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  33.08 
 
 
393 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  33.6 
 
 
395 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  28.65 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  29.87 
 
 
380 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  32.04 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  29.95 
 
 
358 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  29.94 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  28.72 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  28.11 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  37.04 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  26.42 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  24.87 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  37.93 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  30.27 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.06 
 
 
690 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.08 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  21.5 
 
 
366 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  25.57 
 
 
415 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  35.15 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  26.47 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0417  acyltransferase 3  31.17 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  30.41 
 
 
312 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  28.62 
 
 
348 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  28.26 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  26.37 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.77 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  28.61 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  28.61 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  26.97 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  29.82 
 
 
396 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  28.98 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  28.98 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  26.11 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  28.98 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  28.15 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  20.91 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  27.48 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.53 
 
 
638 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  26.02 
 
 
683 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  29.72 
 
 
675 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  32 
 
 
392 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  32 
 
 
392 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  29.64 
 
 
681 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  22.4 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  30.19 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  28.32 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  33.59 
 
 
384 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  32.95 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  31.85 
 
 
423 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  26.32 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  28.32 
 
 
404 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  24.06 
 
 
622 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1498  putative O-antigen acetylase  28.7 
 
 
699 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1805  O-antigen acetylase  28.7 
 
 
728 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  26.48 
 
 
333 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  27.03 
 
 
760 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  25.85 
 
 
710 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  25.85 
 
 
710 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0375  putative acyltransferase  28.7 
 
 
702 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.020751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  27.46 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  27.25 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  26.96 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  21.72 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  25.43 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2108  putative O-antigen acetylase  28.7 
 
 
727 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0472  putative acyltransferase  28.02 
 
 
702 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  22.67 
 
 
398 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  33.54 
 
 
357 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  27.84 
 
 
360 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  27.7 
 
 
354 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  26.53 
 
 
675 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  29.07 
 
 
658 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  30.32 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  27.03 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  32.46 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  30.86 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  28.11 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  27.75 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  24.8 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  32.79 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  22.22 
 
 
349 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  25.69 
 
 
350 aa  49.7  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  32.91 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25262  predicted protein  28.57 
 
 
1062 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417576  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  24.7 
 
 
696 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  28.61 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  23.96 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  26.55 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  30.41 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  28.02 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  25.71 
 
 
777 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  32.69 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  26.55 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  26.55 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.57 
 
 
695 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  21.99 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  26.55 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>