75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3723 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3457  acyltransferase 3  99.22 
 
 
384 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0914284  normal  0.537431 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3723  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  743    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4209  acyltransferase  71.47 
 
 
392 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3594  hypothetical protein  70.08 
 
 
390 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.602516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2593  hypothetical protein  28.02 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110945  normal  0.12741 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2382  acyltransferase family protein  29.44 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  30.33 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1572  acyltransferase 3  32.21 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.653564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1867  acyltransferase-like protein  27.62 
 
 
397 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0282967  hitchhiker  0.0000000000000352917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4628  hypothetical protein  32.74 
 
 
401 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  hitchhiker  0.00905511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0626  acyltransferase  29.04 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2521  acyltransferase family protein  29.86 
 
 
354 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0119  hypothetical protein  27.73 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0158514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  25.43 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  22.6 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  28.22 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  28.78 
 
 
359 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  26.87 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0104  hypothetical protein  28.13 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.402195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  22.81 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  38.71 
 
 
369 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1009  acyltransferase 3  28.07 
 
 
473 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0379524 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01696  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08520)  24.48 
 
 
547 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0457343  normal  0.0488755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  28.29 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  27.71 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4669  acyltransferase 3  33.33 
 
 
485 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53122  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  28.61 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  44.44 
 
 
356 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  26.7 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  24.74 
 
 
374 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  27.59 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  30.05 
 
 
638 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  28.89 
 
 
233 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  28.19 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  28.19 
 
 
408 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  28.57 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  28.57 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  28.57 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  23.06 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  28.57 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  28.06 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  26.87 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  26.87 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  26.87 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  37.5 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  27.16 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  34.43 
 
 
360 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  41.33 
 
 
419 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  35.24 
 
 
366 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.55 
 
 
377 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  36.36 
 
 
432 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  26.1 
 
 
408 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  26.91 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  28.12 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  24.6 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  33.33 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  21.78 
 
 
640 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  28.9 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  36.49 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  26.03 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  24.15 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11061  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 
476 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.101379  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  26.33 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  36.36 
 
 
629 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  37.37 
 
 
647 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  37.37 
 
 
629 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  32.94 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  35.45 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  30.61 
 
 
383 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  26.05 
 
 
373 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  32.94 
 
 
370 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  33.33 
 
 
695 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  28.21 
 
 
382 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  34.62 
 
 
408 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  37.78 
 
 
397 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>