19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2295 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2295  acyltransferase 3  100 
 
 
387 aa  755    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.976705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2806  acyltransferase 3  98.97 
 
 
387 aa  746    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2401  acyltransferase 3  76.1 
 
 
385 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2172  acyltransferase 3  55.73 
 
 
393 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219219  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  47.18 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3139  acyltransferase 3  53.87 
 
 
361 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.586381  normal  0.0112196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3370  acyltransferase 3  47.33 
 
 
370 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3984  acyltransferase 3  47.72 
 
 
363 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  44.54 
 
 
369 aa  238  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2122  acyltransferase 3  42.7 
 
 
367 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0589  acyltransferase 3  44.1 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  34.34 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  28.62 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  25.25 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  22.22 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  21 
 
 
369 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  23.56 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  21 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  22.35 
 
 
344 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>